RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491274.5

SDHB-208, Transcript of succinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit B, humanhuman

TSL 5

Gene SDHB, Length 649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHB-208ENST00000491274 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa7.4□□□□□ -1.22
SDHB-208ENST00000491274 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 LINC01553A4QN01 128 aa7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 CDC25AP30304 524 aa7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 PRPHP41219 470 aa7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 UBA7P41226 1012 aa7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 PHKA2P46019 1235 aa7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 SARSP49591 514 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 RARRES1P49788 294 aa7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 COPS2P61201 443 aa7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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SDHB-208ENST00000491274 SLC17A8Q8NDX2 589 aa7.39□□□□□ -1.23
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SDHB-208ENST00000491274 ANKK1Q8NFD2 765 aa7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 ZNF592Q92610 1267 aa7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 FOXJ1Q92949 421 aa7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 CEP89Q96ST8 783 aa7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 TMX1Q9H3N1 280 aa7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 CHST12Q9NRB3 414 aa7.39□□□□□ -1.23
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SDHB-208ENST00000491274 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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SDHB-208ENST00000491274 TBKBP1A7MCY6 615 aa7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 PP2D1A8MPX8 630 aa7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 STX6O43752 255 aa7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 MGEA5O60502 916 aa7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 DGKIO75912 1065 aa7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 ERLIN2O94905 339 aa7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 ARHGEF15O94989 841 aa7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 LIG1P18858 919 aa7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 CYP11B2P19099 503 aa7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 MUTP22033 750 aa7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 MAPK1P28482 360 aa7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 CTNNB1P35222 781 aa7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 ERVK-21P61565 698 aa7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 PTPROQ16827 1216 aa7.38□□□□□ -1.23
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SDHB-208ENST00000491274 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 TMEM192Q8IY95 271 aa7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 DEPTORQ8TB45 409 aa7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 CALML4Q96GE6 196 aa7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 IFT74Q96LB3 600 aa7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 SAMD11Q96NU1 681 aa7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 PLIN2Q99541 437 aa7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 C17orf80Q9BSJ5 609 aa7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 BHMT2Q9H2M3 363 aa7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 AAASQ9NRG9 546 aa7.38□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 A0A0U1RQF3 1178 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 C9IYK1 514 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 EOMESO95936 686 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 FGFR1P11362 822 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 ARL2P36404 184 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 BMPR1AP36894 532 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 FAM189BP81408 668 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 GRB10Q13322 594 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 GPM6BQ13491 265 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 ADGRE1Q14246 886 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 DSC3Q14574 896 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 PPP2R5AQ15172 486 aa7.37□□□□□ -1.23
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SDHB-208ENST00000491274 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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SDHB-208ENST00000491274 EPC2Q52LR7 807 aa7.37□□□□□ -1.23
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SDHB-208ENST00000491274 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 CABP7Q86V35 215 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 ECHDC2Q86YB7 292 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 IGSF22Q8N9C0 903 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 ASAP3Q8TDY4 903 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 LINC01599Q8WXQ3 324 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 PGBD4Q96DM1 585 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 AK8Q96MA6 479 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 HINFPQ9BQA5 517 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 NT5C3AQ9H0P0 336 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 IFT122Q9HBG6 1241 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 POLD4Q9HCU8 107 aa7.37□□□□□ -1.23
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