RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 HDAC7Q8WUI4 952 aa23.28■■□□□ 1.32
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NELFE-210ENST00000491139 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
NELFE-210ENST00000491139 PCDHA4Q9UN74 947 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-210ENST00000491139 SIT1Q9Y3P8 196 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-210ENST00000491139 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-210ENST00000491139 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
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NELFE-210ENST00000491139 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa23.27■■□□□ 1.32
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NELFE-210ENST00000491139 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
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NELFE-210ENST00000491139 ARL5CA6NH57 179 aa23.25■■□□□ 1.31
NELFE-210ENST00000491139 EML1O00423 815 aa23.25■■□□□ 1.31
NELFE-210ENST00000491139 ERLIN2O94905 339 aa23.25■■□□□ 1.31
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NELFE-210ENST00000491139 TRIM22Q8IYM9 498 aa23.25■■□□□ 1.31
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NELFE-210ENST00000491139 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
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NELFE-210ENST00000491139 IPPQ9Y573 584 aa23.25■■□□□ 1.31
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NELFE-210ENST00000491139 RNF39Q9H2S5 420 aa23.24■■□□□ 1.31
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NELFE-210ENST00000491139 AXLP30530 894 aa23.23■■□□□ 1.31
NELFE-210ENST00000491139 SCNN1GP51170 649 aa23.23■■□□□ 1.31
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NELFE-210ENST00000491139 HTR4Q13639 388 aa23.23■■□□□ 1.31
NELFE-210ENST00000491139 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
NELFE-210ENST00000491139 FERMT3Q86UX7 667 aa23.23■■□□□ 1.31
NELFE-210ENST00000491139 CCDC51Q96ER9 411 aa23.23■■□□□ 1.31
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NELFE-210ENST00000491139 FNIP2Q9P278 1114 aa23.22■■□□□ 1.31
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