RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 CBWD6Q4V339 395 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 CBWD3Q5JTY5 395 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF484Q5JVG2 852 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 CBWD5Q5RIA9 395 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 IQSEC1Q6DN90 963 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 USP37Q86T82 979 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 KIAA1328Q86T90 577 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 GPD1LQ8N335 351 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 MYRIPQ8NFW9 859 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 AFG1LQ8WV93 481 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 SAAL1Q96ER3 474 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 FBXL18Q96ME1 805 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 SPAG5Q96R06 1193 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 KIAA1586Q9HCI6 787 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 SIX2Q9NPC8 291 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 LZTFL1Q9NQ48 299 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 AIPL1Q9NZN9 384 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 DNAI1Q9UI46 699 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 FHOD1Q9Y613 1164 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 SIP14410 1827 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 K7ERI5 159 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 PMM2O15305 246 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 AKR1B10O60218 316 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 HOXC6P09630 235 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 SMPD1P17405 629 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 RFX1P22670 979 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 HOXD10P28358 340 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGAP25P42331 645 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 FLT3LGP49771 235 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 KIF11P52732 1056 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 EFNA5P52803 228 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 HGSNATQ68CP4 663 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 SLFN12LQ6IEE8 588 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF662Q6ZS27 426 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 CBWD2Q8IUF1 395 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 SLAIN1Q8ND83 568 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 OR6J1Q8NGC5 347 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 RAET1EQ8TD07 263 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 TMC2Q8TDI7 906 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 MFSD14AQ96MC6 490 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 C2orf40Q9H1Z8 148 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 DEF6Q9H4E7 631 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 HAUS4Q9H6D7 363 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 SUGCTQ9HAC7 445 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 STYXL1Q9Y6J8 313 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 FRMPD3Q5JV73 1810 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 COL1A2P08123 1366 aa11.28□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 DOCK3Q8IZD9 2030 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 UQCRHLA0A096LP55 91 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A0U1RQJ8 604 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 EXTL3O43909 919 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 PPFIA4O75335 1185 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 LCA5LO95447 670 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 MYCP01106 439 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 UQCRHP07919 91 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 ELNP15502 786 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 CASQ1P31415 396 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 GTF2H1P32780 548 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 RGS2P41220 211 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 MXI1P50539 228 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 JAM2P57087 298 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 DLG4P78352 724 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 CYP24A1Q07973 514 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP3CAQ08209 521 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 KLHL30Q0D2K2 578 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 DRP2Q13474 957 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 TFDP1Q14186 410 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 C1orf220Q5T0J3 134 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 IQCEQ6IPM2 695 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 FMNL3Q8IVF7 1028 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 TXLNBQ8N3L3 684 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 EHBP1Q8NDI1 1231 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 PLEKHO2Q8TD55 490 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 ATRIPQ8WXE1 791 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 SOCS4Q8WXH5 440 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 USP6NLQ92738 828 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 JAKMIP2Q96AA8 810 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 TSGA10Q9BZW7 698 aa11.27□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
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