RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, human

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO18-208	ENST00000470089	DRC1	Q96MC2	740 aa		32.32	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	IGFLR1	Q9H665	355 aa		32.32	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	TLR9	Q9NR96	1032 aa		32.32	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC26A4	O43511	780 aa		32.31	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	B4GALT3	O60512	393 aa		32.31	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	POMC	P01189	267 aa		32.31	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	GUCY2C	P25092	1073 aa		32.31	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	PPM1A	P35813	382 aa		32.31	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	NPTX2	P47972	431 aa		32.31	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	ERVFC1	P60507	584 aa		32.31	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	PLCB3	Q01970	1234 aa		32.31	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	AAK1	Q2M2I8	961 aa		32.31	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	USP49	Q70CQ1	688 aa		32.31	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		32.31	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		32.31	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	CLIC6	Q96NY7	704 aa		32.31	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		32.31	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		32.31	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		32.3	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	ACKR2	O00590	384 aa		32.3	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	PLCG1	P19174	1290 aa		32.3	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	KCNA5	P22460	613 aa		32.3	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	EFNA5	P52803	228 aa		32.3	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	EPSTI1	Q96J88	318 aa		32.3	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	GAD1	Q99259	594 aa		32.3	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		32.3	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	CLDND1	Q9NY35	253 aa		32.3	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	N4BP3	O15049	544 aa		32.29	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	AKAP5	P24588	427 aa		32.29	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	MLH1	P40692	756 aa		32.29	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	ZFP42	Q96MM3	310 aa		32.29	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		32.29	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		32.29	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	DDHD2	O94830	711 aa		32.28	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	KRT17	Q04695	432 aa		32.28	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		32.28	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	HACE1	Q8IYU2	909 aa		32.28	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		32.28	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		32.28	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	LZTS1	Q9Y250	596 aa		32.28	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	ARL5C	A6NH57	179 aa		32.27	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089		K7ERI5	159 aa		32.27	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	GALT	P07902	379 aa		32.27	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC11A1	P49279	550 aa		32.27	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	MCM6	Q14566	821 aa		32.27	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	ARSH	Q5FYA8	562 aa		32.27	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		32.27	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		32.27	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	GPBP1	Q86WP2	473 aa		32.27	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	MIOS	Q9NXC5	875 aa		32.27	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		32.27	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	PARP2	Q9UGN5	583 aa		32.27	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC16A4	O15374	487 aa		32.26	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	LINC01565	O15544	149 aa		32.26	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	BMP1	P13497	986 aa		32.26	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	NRIP1	P48552	1158 aa		32.26	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	SCNN1G	P51170	649 aa		32.26	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC39A14	Q15043	492 aa		32.26	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	RAD54L	Q92698	747 aa		32.26	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		32.26	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	TMEM169	Q96HH4	297 aa		32.26	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	TCF25	Q9BQ70	676 aa		32.26	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		32.26	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	KLK14	Q9P0G3	267 aa		32.26	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		32.26	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		32.26	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	FSCN2	O14926	492 aa		32.25	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	COL19A1	Q14993	1142 aa		32.25	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		32.25	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	KCND2	Q9NZV8	630 aa		32.25	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		32.25	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	PLS3	P13797	630 aa		32.24	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	PKP1	Q13835	747 aa		32.24	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	STK38	Q15208	465 aa		32.24	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		32.24	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		32.24	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		32.24	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		32.24	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	PER2	O15055	1255 aa		32.23	■■■□□ 2.75

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