RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464280.5

NISCH-204, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 3

Gene NISCH, Length 833 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-204ENST00000464280 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 KMT5AQ9NQR1 393 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 STK17AQ9UEE5 414 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 ODF2LQ9ULJ1 636 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 IPPQ9Y573 584 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 MEIS3P2A8K0S8 358 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 H0YCG3 227 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 FGF18O76093 207 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 NPTXRO95502 500 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 PLS3P13797 630 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 LIG1P18858 919 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 KRT17Q04695 432 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 MAPK7Q13164 816 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 GPBP1Q86WP2 473 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 PPP2R3CQ969Q6 453 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 KIFC3Q9BVG8 833 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 TBC1D13Q9NVG8 400 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 THEGQ9P2T0 379 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 HCSTQ9UBK5 93 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 CFAP45Q9UL16 551 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 COG5Q9UP83 839 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 SFI1A8K8P3 1242 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP12.84□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 KRT18P05783 430 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 SCP2P22307 547 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 BCAR1P56945 870 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 PLCB3Q01970 1234 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 MCM6Q14566 821 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 AAK1Q2M2I8 961 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 ARSHQ5FYA8 562 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 ATF7IP2Q5U623 682 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 RRAGBQ5VZM2 374 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 USP49Q70CQ1 688 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 KCNG4Q8TDN1 519 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 POF1BQ8WVV4 589 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 SPIRE2Q8WWL2 714 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 HLA-CQ95604 372 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 PDZD7Q9H5P4 517 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 SPG21Q9NZD8 308 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 LZTS1Q9Y250 596 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 GIT1Q9Y2X7 761 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-204ENST00000464280 ARL5CA6NH57 179 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 INPPL1O15357 1258 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 SLC16A4O15374 487 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 NCK2O43639 380 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 FAM13AO94988 1023 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 STRN3Q13033 797 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 PKP1Q13835 747 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 SV2BQ7L1I2 683 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 LRRC15Q8TF66 581 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 REEP2Q9BRK0 252 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 APOL6Q9BWW8 343 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 PARVGQ9HBI0 331 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 PRDM6Q9NQX0 595 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 TLR9Q9NR96 1032 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 HES2Q9Y543 173 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 TTLL13PA6NNM8 815 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 CUTAO60888 179 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 TBCAO75347 108 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 BRD1O95696 1058 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 POMCP01189 267 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 ABCD1P33897 745 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 MLH1P40692 756 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 STAT6P42226 847 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 ZNF131P52739 623 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 CAMK1Q14012 370 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 GIT2Q14161 759 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 TCEAL5Q5H9L2 206 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 NT5DC1Q5TFE4 455 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 SLC39A11Q8N1S5 342 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-204ENST00000464280 MYCT1Q8N699 235 aa12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms