RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 HACE1Q8IYU2 909 aa22.86■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 APOL6Q9BWW8 343 aa22.86■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.86■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.86■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.86■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 USP20Q9Y2K6 914 aa22.86■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.85■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 K7ERI5 159 aa22.85■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 SPTLC2O15270 562 aa22.85■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 YEATS4O95619 227 aa22.85■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 PLS3P13797 630 aa22.85■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 PPM1AP35813 382 aa22.85■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 UBE3AQ05086 875 aa22.85■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 CAMK1Q14012 370 aa22.85■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 ARSHQ5FYA8 562 aa22.85■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.85■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 RNF39Q9H2S5 420 aa22.85■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.85■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 REEP2Q9BRK0 252 aa22.84■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.84■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 GBP3Q9H0R5 595 aa22.84■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.84■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 STK17AQ9UEE5 414 aa22.84■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.84■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.84■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 SLC16A4O15374 487 aa22.83■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 PPP6R2O75170 966 aa22.83■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 MLH1P40692 756 aa22.83■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 SMTNP53814 917 aa22.83■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 BCAR1P56945 870 aa22.83■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 PLCB3Q01970 1234 aa22.83■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.83■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.83■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.83■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.83■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.83■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 SPG21Q9NZD8 308 aa22.83■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 KANSL3Q9P2N6 904 aa22.83■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 COG5Q9UP83 839 aa22.83■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.83■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 MYO7AQ13402 2215 aa22.83■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 REV3LO60673 3130 aa22.83■■□□□ 1.24
VARS-218ENST00000459667 ARL5CA6NH57 179 aa22.82■■□□□ 1.24
VARS-218ENST00000459667 POMCP01189 267 aa22.82■■□□□ 1.24
VARS-218ENST00000459667 AKAP5P24588 427 aa22.82■■□□□ 1.24
VARS-218ENST00000459667 IRS1P35568 1242 aa22.82■■□□□ 1.24
VARS-218ENST00000459667 DDIT3P35638 169 aa22.82■■□□□ 1.24
VARS-218ENST00000459667 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.82■■□□□ 1.24
VARS-218ENST00000459667 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.82■■□□□ 1.24
VARS-218ENST00000459667 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.82■■□□□ 1.24
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VARS-218ENST00000459667 GAD1Q99259 594 aa22.82■■□□□ 1.24
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VARS-218ENST00000459667 PARP2Q9UGN5 583 aa22.82■■□□□ 1.24
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VARS-218ENST00000459667 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.81■■□□□ 1.24
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VARS-218ENST00000459667 FAM13AO94988 1023 aa22.81■■□□□ 1.24
VARS-218ENST00000459667 KRT17Q04695 432 aa22.81■■□□□ 1.24
VARS-218ENST00000459667 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.81■■□□□ 1.24
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VARS-218ENST00000459667 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.81■■□□□ 1.24
VARS-218ENST00000459667 ZNF280BQ86YH2 543 aa22.81■■□□□ 1.24
VARS-218ENST00000459667 ZFP42Q96MM3 310 aa22.81■■□□□ 1.24
VARS-218ENST00000459667 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
VARS-218ENST00000459667 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
VARS-218ENST00000459667 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.81■■□□□ 1.24
VARS-218ENST00000459667 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
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VARS-218ENST00000459667 DDHD2O94830 711 aa22.8■■□□□ 1.24
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VARS-218ENST00000459667 TFF2Q03403 129 aa22.8■■□□□ 1.24
VARS-218ENST00000459667 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
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VARS-218ENST00000459667 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.8■■□□□ 1.24
VARS-218ENST00000459667 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
VARS-218ENST00000459667 UNC80Q8N2C7 3258 aa22.79■■□□□ 1.24
VARS-218ENST00000459667 CUTAO60888 179 aa22.79■■□□□ 1.24
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