RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448828.5

NME4-206, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2

Gene NME4, Length 1,167 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-206ENST00000448828 ECM1Q16610 540 aa25.13■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 KRT79Q5XKE5 535 aa25.13■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 SLC27A1Q6PCB7 646 aa25.13■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 DEPTORQ8TB45 409 aa25.13■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 GAD1Q99259 594 aa25.13■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 RNF39Q9H2S5 420 aa25.13■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 STK24Q9Y6E0 443 aa25.13■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 FAM86C2PA6NEL3 165 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 C2orf71A6NGG8 1288 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 PP2D1A8MPX8 630 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 DDHD2O94830 711 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 CXCL14O95715 111 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 CYP11B2P19099 503 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 COL9A1P20849 921 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 RILPL1Q5EBL4 403 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 DTHD1Q6ZMT9 781 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 ZBP1Q9H171 429 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 C2orf40Q9H1Z8 148 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 FAN1Q9Y2M0 1017 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 ARL5CA6NH57 179 aa25.11■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 OR1G1P47890 313 aa25.11■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 SCNN1GP51170 649 aa25.11■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 PDIA5Q14554 519 aa25.11■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 PPP2R5AQ15172 486 aa25.11■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 TMEM31Q5JXX7 168 aa25.11■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 IGSF22Q8N9C0 903 aa25.11■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 BSNDQ8WZ55 320 aa25.11■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 IFT74Q96LB3 600 aa25.11■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 ZFP42Q96MM3 310 aa25.11■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 POLD4Q9HCU8 107 aa25.11■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 PARP2Q9UGN5 583 aa25.11■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 ALDH2P05091 517 aa25.1■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 AKAP5P24588 427 aa25.1■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 MAPK6Q16659 721 aa25.1■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 ANKRD54Q6NXT1 300 aa25.1■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 CASP10Q92851 521 aa25.1■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 PRIMPOLQ96LW4 560 aa25.1■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 TMEM175Q9BSA9 504 aa25.1■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa25.1■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 NCOR1O75376 2440 aa25.1■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 PI4K2BG5E9Z4 385 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 NRP1O14786 923 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 PRKCBP05771 671 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 CTSAP10619 480 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 ALADP13716 330 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 CDC25AP30304 524 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 PRPHP41219 470 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 NAMPTP43490 491 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 RPS6KC1Q96S38 1066 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 KIFC3Q9BVG8 833 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 KLK14Q9P0G3 267 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 DNM3Q9UQ16 869 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 GIT1Q9Y2X7 761 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 A0A1B0GUA9 196 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 C19orf67A6NJJ6 358 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 SPDYE4A6NLX3 237 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 E9PMD0 336 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 NR1I2O75469 434 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 KIFAP3Q92845 792 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 N4BP3O15049 544 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 DCXO43602 365 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 KCNC3Q14003 757 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 GIT2Q14161 759 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 IL17AQ16552 155 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 ADPGKQ9BRR6 497 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 FZD8Q9H461 694 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 USP20Q9Y2K6 914 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 BDP1A6H8Y1 2624 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 VWA3AA6NCI4 1184 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 C2CD2LO14523 706 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 TPRNQ4KMQ1 711 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 COLGALT2Q8IYK4 626 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 LRFN3Q9BTN0 628 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 VN1R3Q9BXE9 311 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 PDZD7Q9H5P4 517 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 STK39Q9UEW8 545 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 TTLL13PA6NNM8 815 aa25.05■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 CCDC169A6NNP5 214 aa25.05■■□□□ 1.6
NME4-206ENST00000448828 URODP06132 367 aa25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms