RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435991.2

TRAPPC13P1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13 pseudogene 1, humanhuman

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Gene TRAPPC13P1, Length 1,062 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TTC17Q96AE7 1141 aa6.34□□□□□ -1.39
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.34□□□□□ -1.39
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.34□□□□□ -1.39
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ACAP3Q96P50 834 aa6.34□□□□□ -1.39
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.34□□□□□ -1.39
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OBP2AQ9NY56 170 aa6.34□□□□□ -1.39
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 VWA7Q9Y334 891 aa6.34□□□□□ -1.39
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CYP27B1O15528 508 aa6.33□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CD40P25942 277 aa6.33□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IRF9Q00978 393 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MAP3K12Q12852 859 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PICALMQ13492 652 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LRRC32Q14392 662 aa6.33□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa6.33□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TCIRG1Q13488 830 aa6.32□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TERF2Q15554 542 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NME9Q86XW9 330 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMPRSS6Q8IU80 811 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SVIPQ8NHG7 77 aa6.32□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CEP72Q9P209 647 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.32□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CAPN14A8MX76 684 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IL33O95760 270 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TRIM27P14373 513 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 INHBCP55103 352 aa6.31□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FOXB1Q99853 325 aa6.31□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TOMM22Q9NS69 142 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TGM5O43548 720 aa6.3□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KRT37O76014 449 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PEX11BO96011 259 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ADH4P08319 380 aa6.3□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MAKP20794 623 aa6.3□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GBX1Q14549 363 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.3□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SARGQ9BW04 601 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C1orf112Q9NSG2 853 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ANO9A1A5B4 782 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MTHFD2P13995 350 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KIF11P52732 1056 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SCAND1P57086 179 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ADAM15Q13444 863 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CLUL1Q15846 466 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TPH2Q8IWU9 490 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.29□□□□□ -1.4
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