RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428457.1

TNS3-204, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TNS3, Length 5,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-204ENST00000428457 C9orf131Q5VYM1 1079 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 RINT1Q6NUQ1 792 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 LY9Q9HBG7 655 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 L1RE1Q9UN81 338 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 RGL2O15211 777 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 SCARF1Q14162 830 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 NCAPHQ15003 741 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 KYAT1Q16773 422 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 MAP7D3Q8IWC1 876 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 MCPH1Q8NEM0 835 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 ANAPC7Q9UJX3 599 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 RFX7Q2KHR2 1363 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 WDR46O15213 610 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 CAMTA2O94983 1202 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 LDHAP00338 332 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 RCAN1P53805 252 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 ARL8AQ96BM9 186 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 TRIM11Q96F44 468 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 RMDN3Q96TC7 470 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 FUCA2Q9BTY2 467 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 C2orf40Q9H1Z8 148 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 TUBE1Q9UJT0 475 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 LZTS1Q9Y250 596 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 LRRC7Q96NW7 1537 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 DPYSL4O14531 572 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 ATICP31939 592 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 CIITAP33076 1130 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 DEUP1Q05D60 604 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 MDH1BQ5I0G3 518 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 DNAJC24Q6P3W2 148 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 EEPD1Q7L9B9 569 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 C1orf54Q8WWF1 131 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 OLFM3Q96PB7 478 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 SERPINI1Q99574 410 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 STK36Q9NRP7 1315 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 CCT8L1PA6NM43 557 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 ZBTB5O15062 677 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 RAD51CO43502 376 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 SERPINB4P48594 390 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 STX1BP61266 288 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 COG2Q14746 738 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 ANKRD40Q6AI12 368 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 PDXDC1Q6P996 788 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 ZNF34Q8IZ26 560 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 DONSONQ9NYP3 566 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 GGA3Q9NZ52 723 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 NRKQ7Z2Y5 1582 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 ESYT2A0FGR8 921 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 MED7O43513 233 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 SASH3O75995 380 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 LONRF1Q17RB8 773 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 OLFML2BQ68BL8 750 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 GLYCTKQ8IVS8 523 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 ARHGAP18Q8N392 663 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 FAM151AQ8WW52 585 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 ERP27Q96DN0 273 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 BHMT2Q9H2M3 363 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 PSMD14O00487 310 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 GNGT2O14610 69 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 PDHBP11177 359 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 CCND1P24385 295 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 MTERF2Q49AM1 385 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 WDR64B1ANS9 1081 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 NMT2O60551 498 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 CCL15Q16663 113 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 RABGAP1LQ5R372 815 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 DSTYKQ6XUX3 929 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 NUDT18Q6ZVK8 323 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 TRIM59Q8IWR1 403 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 ZNF280CQ8ND82 737 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 DNAJC9Q8WXX5 260 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 SUPT3HO75486 399 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 MYBL1P10243 752 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 CHRNA3P32297 505 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS3-204ENST00000428457 NOP14P78316 857 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms