RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428316.1

RPSAP46-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 46, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP46, Length 882 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP46-201ENST00000428316 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 FAM173BQ6P4H8 233 aa13.42□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 SLC27A1Q6PCB7 646 aa13.42□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 KCTD17Q8N5Z5 321 aa13.42□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa13.42□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 KIFAP3Q92845 792 aa13.42□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 GAD1Q99259 594 aa13.42□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 PLIN2Q99541 437 aa13.42□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 KIFC3Q9BVG8 833 aa13.42□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 VN1R3Q9BXE9 311 aa13.42□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 C2orf40Q9H1Z8 148 aa13.42□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 UBN1Q9NPG3 1134 aa13.42□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 KANSL3Q9P2N6 904 aa13.42□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa13.42□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 GIT1Q9Y2X7 761 aa13.42□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 CLIC4Q9Y696 253 aa13.42□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP13.41□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 PDCP20941 246 aa13.41□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 AKAP5P24588 427 aa13.41□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 NPTX2P47972 431 aa13.41□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 DSC1Q08554 894 aa13.41□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 ARSHQ5FYA8 562 aa13.41□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa13.41□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 TAS1R3Q7RTX0 852 aa13.41□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 FAM178BQ8IXR5 827 aa13.41□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 COLGALT2Q8IYK4 626 aa13.41□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 AK8Q96MA6 479 aa13.41□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 ZFP42Q96MM3 310 aa13.41□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 TCF25Q9BQ70 676 aa13.41□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 CXCL16Q9H2A7 254 aa13.41□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 PDZD7Q9H5P4 517 aa13.41□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 TLE6Q9H808 572 aa13.41□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 FOXD4L1Q9NU39 408 aa13.41□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 BRWD1Q9NSI6 2320 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 C2orf71A6NGG8 1288 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 SFI1A8K8P3 1242 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 NRP1O14786 923 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 MBTPS2O43462 519 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 NPTXRO95502 500 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 ALDH2P05091 517 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 GUCY2CP25092 1073 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 MLH1P40692 756 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 COASYQ13057 564 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 PPP2R5AQ15172 486 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 MAPK6Q16659 721 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 PLPP4Q5VZY2 271 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 EEF1DP3Q658K8 133 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 CABP7Q86V35 215 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 DEPTORQ8TB45 409 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 TMEM175Q9BSA9 504 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 NT5C3AQ9H0P0 336 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 ZBP1Q9H171 429 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 TMEM134Q9H6X4 195 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 PTPRHQ9HD43 1115 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 MARCH5Q9NX47 278 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa13.4□□□□□ -0.26
RPSAP46-201ENST00000428316 SLC26A4O43511 780 aa13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 LILRB3O75022 631 aa13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 BMP15O95972 392 aa13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 PRKCBP05771 671 aa13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 PLA2G4BP0C869 781 aa13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 CTSAP10619 480 aa13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 LONP1P36776 959 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 SCNN1GP51170 649 aa13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 EFNA5P52803 228 aa13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 PEX3P56589 373 aa13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 EP400NLQ6ZTU2 488 aa13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 USP49Q70CQ1 688 aa13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 TMC7Q7Z402 723 aa13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 VPS52Q8N1B4 723 aa13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 URGCPQ8TCY9 931 aa13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 PPP2R3CQ969Q6 453 aa13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 IFT74Q96LB3 600 aa13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 CCSER1Q9C0I3 900 aa13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 GBP3Q9H0R5 595 aa13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 S1PR5Q9H228 398 aa13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 C17orf75Q9HAS0 396 aa13.39□□□□□ -0.27
RPSAP46-201ENST00000428316 KLK14Q9P0G3 267 aa13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms