RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 POMKQ9H5K3 350 aa23.31■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 MUC6Q6W4X9 2439 aa23.31■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 ARL5CA6NH57 179 aa23.3■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 LILRB3O75022 631 aa23.3■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 EPCAMP16422 314 aa23.3■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 FOSBP53539 338 aa23.3■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 DSC1Q08554 894 aa23.3■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 COLGALT2Q8IYK4 626 aa23.3■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 HACE1Q8IYU2 909 aa23.3■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 PIGOQ8TEQ8 1089 aa23.3■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa23.3■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 GIT1Q9Y2X7 761 aa23.3■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 EFEMP2O95967 443 aa23.29■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 SOD2P04179 222 aa23.29■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 MCM7P33993 719 aa23.29■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.29■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.29■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 MCPH1Q8NEM0 835 aa23.29■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 ASIC4Q96FT7 647 aa23.29■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 CPB2Q96IY4 423 aa23.29■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 C8orf76Q96K31 380 aa23.29■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 PRIMPOLQ96LW4 560 aa23.29■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 FBXL18Q96ME1 805 aa23.29■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa23.29■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 SFXN1Q9H9B4 322 aa23.29■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 MARCH5Q9NX47 278 aa23.29■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 CDH22Q9UJ99 828 aa23.29■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa23.29■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 USO1O60763 962 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 MUTP22033 750 aa23.28■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 MLH1P40692 756 aa23.28■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 CLCN4P51793 760 aa23.28■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 SLC27A1Q6PCB7 646 aa23.28■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.28■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 PBXIP1Q96AQ6 731 aa23.28■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 KLHL5Q96PQ7 755 aa23.28■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 NACC1Q96RE7 527 aa23.28■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 GAD1Q99259 594 aa23.28■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 RNF39Q9H2S5 420 aa23.28■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 USTQ9Y2C2 406 aa23.28■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 KMT2EQ8IZD2 1858 aa23.28■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GUA9 196 aa23.27■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 MED24O75448 989 aa23.27■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 CNPP09543 421 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 RPA1P27694 616 aa23.27■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 GUCY1B3Q02153 619 aa23.27■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 ATAT1Q5SQI0 421 aa23.27■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 CABP7Q86V35 215 aa23.27■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.27■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 ERMNQ8TAM6 284 aa23.27■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 HES2Q9Y543 173 aa23.27■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 C2CD4DB7Z1M9 353 aa23.26■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 URODP06132 367 aa23.26■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 OR52Z1P0C646 297 aa23.26■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 TRAPPC10P48553 1259 aa23.26■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 SCNN1GP51170 649 aa23.26■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 NHLH1Q02575 133 aa23.26■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 FAM187BQ17R55 369 aa23.26■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa23.26■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 FBXL6Q8N531 539 aa23.26■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 PRRX2Q99811 253 aa23.26■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 SORCS3Q9UPU3 1222 aa23.26■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 B4GALT5O43286 388 aa23.25■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 NR1I2O75469 434 aa23.25■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa23.25■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 GPR65Q8IYL9 337 aa23.25■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 UBALD2Q8IYN6 164 aa23.25■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 GSTCDQ8NEC7 633 aa23.25■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 ZFP42Q96MM3 310 aa23.25■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 RPS6KC1Q96S38 1066 aa23.25■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 C2orf40Q9H1Z8 148 aa23.25■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 FZD8Q9H461 694 aa23.25■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 GPRC5CQ9NQ84 441 aa23.25■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.25■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 MIOSQ9NXC5 875 aa23.25■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 LRRIQ4A6NIV6 560 aa23.24■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 C1RP00736 705 aa23.24■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 ATP2B1P20020 1258 aa23.24■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 SP100P23497 879 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
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