RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 FAM186BQ8IYM0 893 aa26.47■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 SGIP1Q9BQI5 828 aa26.47■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa26.47■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa26.47■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 DHX15O43143 795 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 DUPD1Q68J44 220 aa26.47■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 FUKQ8N0W3 1084 aa26.47■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 CARD9Q9H257 536 aa26.47■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa26.47■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 TKFCQ3LXA3 575 aa26.46■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 ERMARDQ5T6L9 678 aa26.46■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa26.46■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 GLYCTKQ8IVS8 523 aa26.46■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 ERP44Q9BS26 406 aa26.46■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 HOMER2Q9NSB8 354 aa26.46■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa26.46■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 SCTRP47872 440 aa26.46■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 DR1Q01658 176 aa26.46■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 PLS1Q14651 629 aa26.46■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 PCNX4Q63HM2 1172 aa26.46■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 CYB5D1Q6P9G0 228 aa26.46■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 TAX1BP1Q86VP1 789 aa26.46■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 CHMP6Q96FZ7 201 aa26.46■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa26.46■■□□□ 1.83
FAAP20-206ENST00000414253 HIP1RO75146 1068 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 CAND2O75155 1236 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 NUDT17P0C025 328 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 MAPK7Q13164 816 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 HS2ST1Q7LGA3 356 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 DAW1Q8N136 415 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 MKNK1Q9BUB5 465 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 STK33Q9BYT3 514 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 CXorf56Q9H5V9 222 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 FAM187AA6NFU0 413 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 P4HBP07237 508 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 PARP9Q8IXQ6 854 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 CCT6BQ92526 530 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 SGSM3Q96HU1 749 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 FAM129AQ9BZQ8 928 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 EPB41L4BQ9H329 900 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 KDM4CQ9H3R0 1056 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 DMAC2Q9NW81 257 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 PNMA2Q9UL42 364 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 SNCBQ16143 134 aa26.44■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 PADI6Q6TGC4 694 aa26.44■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 CCDC50Q8IVM0 306 aa26.44■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 MDM1Q8TC05 714 aa26.44■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 SYT11Q9BT88 431 aa26.44■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 GINM1Q9NU53 330 aa26.44■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 CCDC172P0C7W6 258 aa26.43■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 GHRP10912 638 aa26.43■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 STRA6Q9BX79 667 aa26.43■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 HAUS2Q9NVX0 235 aa26.43■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 VCAM1P19320 739 aa26.43■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 ABCB4P21439 1286 aa26.43■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 RPS12P25398 132 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 XRCC4Q13426 336 aa26.43■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 TAAR1Q96RJ0 339 aa26.43■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 ZHX2Q9Y6X8 837 aa26.43■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 CYP2J2P51589 502 aa26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 PMS2P54278 862 aa26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 MTMR2Q13614 643 aa26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 CLUL1Q15846 466 aa26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 SAMD7Q7Z3H4 446 aa26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 ERVK-5Q9HDB9 667 aa26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 DNAJC12Q9UKB3 198 aa26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 SHBGP04278 402 aa26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 RPS6P62753 249 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 MTMR1Q13613 665 aa26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 HVCN1Q96D96 273 aa26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 PGM2Q96G03 612 aa26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 FMO5P49326 533 aa26.41■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 DRG2P55039 364 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 WLSQ5T9L3 541 aa26.41■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa26.41■■□□□ 1.82
FAAP20-206ENST00000414253 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms