RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413658.6

ZNF3-205, Transcript of zinc finger protein 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF3, Length 1,441 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF3-205	ENST00000413658	SCP2	P22307	547 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	KCNA1	Q09470	495 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	STK4	Q13043	487 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	CAMK4	Q16566	473 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	MAPK6	Q16659	721 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	RASIP1	Q5U651	963 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	CPB2	Q96IY4	423 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	GSDMA	Q96QA5	445 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	EXOC1	Q9NV70	894 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	TBX20	Q9UMR3	447 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	COL4A6	Q14031	1691 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	ANK1	P16157	1881 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658		A0A1B0GUA9	196 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658		H0YCG3	227 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	ENPP3	O14638	875 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	ABLIM1	O14639	778 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	ERLIN2	O94905	339 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	PIGR	P01833	764 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	FGB	P02675	491 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	C7	P10643	843 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	AXL	P30530	894 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	BMP8B	P34820	402 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	UBXN11	Q5T124	520 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	HERVK_113	Q902F9	699 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	HVCN1	Q96D96	273 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	ADAM2	Q99965	735 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	CHST12	Q9NRB3	414 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	RGS18	Q9NS28	235 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658		C9IYK1	514 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	BAIAP3	O94812	1187 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	SMC2	O95347	1197 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	GCNT3	O95395	438 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	BMP6	P22004	513 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	PROZ	P22891	400 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	ABCD1	P33897	745 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	FAM189B	P81408	668 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	PSMD2	Q13200	908 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	ALCAM	Q13740	583 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	IKBKE	Q14164	716 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	SHH	Q15465	462 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	SMARCE1	Q969G3	411 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	GDA	Q9Y2T3	454 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	TISP43	B9A030	160 aa		11.27	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	DEFB103A	P81534	67 aa		11.27	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	STRN3	Q13033	797 aa		11.27	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	MORC3	Q14149	939 aa		11.27	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	NFKBIB	Q15653	356 aa		11.27	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		11.27	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		11.27	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	NOTUM	Q6P988	496 aa		11.27	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	ZPBP2	Q6X784	338 aa		11.27	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	CCDC51	Q96ER9	411 aa		11.27	□□□□□ -0.6
ZNF3-205	ENST00000413658	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6

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