RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM204AQ9H8W3 233 aa4.72□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa4.72□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM260Q9NX78 707 aa4.72□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 DKK3Q9UBP4 350 aa4.72□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 TEKT2Q9UIF3 430 aa4.72□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 GOLGA8IPA6NC78 632 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF233A6NK53 670 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 TRAPPC3O43617 180 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 DIAPH2O60879 1101 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 RPS6KA5O75582 802 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 MMEP08473 750 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 STAG3L1P0CL83 205 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 AKR1A1P14550 325 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 PTPRAP18433 802 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 SMARCA1P28370 1054 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 STAT1P42224 750 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 NLRP12P59046 1061 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 SNX1Q13596 522 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 C1orf228Q6PIY5 440 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIML1Q8N9V2 468 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 BEST2Q8NFU1 509 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.655e-8■■■■■ 65.3
ANKRD28-202ENST00000412318 RUNDC3BQ96NL0 473 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 NT5C1BQ96P26 610 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 SYBUQ9NX95 663 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 IFNKQ9P0W0 207 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 MBD2Q9UBB5 411 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 PCDHA7Q9UN72 937 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF148Q9UQR1 794 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 CLIC4Q9Y696 253 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 KIF20BQ96Q89 1820 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 PIK3C2AO00443 1686 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 NHSQ6T4R5 1651 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 IRF6O14896 467 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 HBP1O60381 514 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 PGK2P07205 417 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 MCF2P10911 925 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 NR2F2P24468 414 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 CDC25AP30304 524 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 MUM1L1Q5H9M0 696 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 CYP26C1Q6V0L0 522 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 UBL4BQ8N7F7 174 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 GMCL1Q96IK5 515 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM81BQ96LP2 452 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 MAP3K14Q99558 947 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 AAASQ9NRG9 546 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 MYPNQ86TC9 1320 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 C17orf102A2RUQ5 167 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 OATP04181 439 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 CARSP49589 748 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 EFNA5P52803 228 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 ETF1P62495 437 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 ERVK-9P63128 1117 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 ERVK-24P63145 666 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 TSPY1Q01534 308 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 KLHL30Q0D2K2 578 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 PLCB4Q15147 1175 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 LRRC8BQ6P9F7 803 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP6V1E2Q96A05 226 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM149B1Q96BN6 582 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 HIC2Q96JB3 615 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 CNBD2Q96M20 576 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 GSDMAQ96QA5 445 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 SERPINI1Q99574 410 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 LXNQ9BS40 222 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 KCNF1Q9H3M0 494 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 PCIF1Q9H4Z3 704 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 LRRC4Q9HBW1 653 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 KIAA1586Q9HCI6 787 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 TAB2Q9NYJ8 693 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF541Q9H0D2 1346 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC151A5D8V7 595 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 E7ENQ6 273 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 H0YC42 278 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 HGSO14964 777 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 ASAP2O43150 1006 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 HUS1O60921 280 aa4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms