RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 POMGNT1Q8WZA1 660 aa21.84■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 CEP89Q96ST8 783 aa21.84■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 AGPAT1Q99943 283 aa21.84■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 KIFC3Q9BVG8 833 aa21.84■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 ATP4AP20648 1035 aa21.83■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 NOP2P46087 812 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 MFAP3P55082 362 aa21.83■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 CLDN10P78369 228 aa21.83■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 CASP8Q14790 479 aa21.83■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 FAM160B1Q5W0V3 765 aa21.83■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 GADL1Q6ZQY3 521 aa21.83■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 FAM71AQ8IYT1 594 aa21.83■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 ACTRT1Q8TDG2 376 aa21.83■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 SOWAHBA6NEL2 793 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 CXCR5P32302 372 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 ARL2P36404 184 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 ARHGAP44Q17R89 818 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 MTERF2Q49AM1 385 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 METTL7BQ6UX53 244 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 TAS1R3Q7RTX0 852 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 ARHGEF19Q8IW93 802 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 RHOT2Q8IXI1 618 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 FBXL13Q8NEE6 735 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 SHC3Q92529 594 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 FAM167AQ96KS9 214 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 NRBP2Q9NSY0 501 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 EXTL3O43909 919 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 CNMDO75829 334 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 GZMAP12544 262 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 SLFN12LQ6IEE8 588 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 SLC7A3Q8WY07 619 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 SELENOOQ9BVL4 669 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 ISCUQ9H1K1 167 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 ELP3Q9H9T3 547 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 TMEM59LQ9UK28 342 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 CLSTN1O94985 981 aa21.81■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 STRN3Q13033 797 aa21.81■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 SEPT14Q6ZU15 432 aa21.81■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 NCAPG2Q86XI2 1143 aa21.81■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 EXOC8Q8IYI6 725 aa21.81■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.81■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 SAAL1Q96ER3 474 aa21.81■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 CDCA5Q96FF9 252 aa21.81■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 TMEM134Q9H6X4 195 aa21.81■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 STIM2Q9P246 746 aa21.81■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.81■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.8■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 GOLGA8IPA6NC78 632 aa21.8■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF233A6NK53 670 aa21.8■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 GOLGA8JA6NMD2 632 aa21.8■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 GAS2O43903 313 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 SP4Q02446 784 aa21.8■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 SMYD5Q6GMV2 418 aa21.8■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 C8orf74Q6P047 294 aa21.8■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa21.8■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 USP38Q8NB14 1042 aa21.8■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 OTUD5Q96G74 571 aa21.8■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 NT5C1BQ96P26 610 aa21.8■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 RAB20Q9NX57 234 aa21.8■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 LRRN2O75325 713 aa21.8■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 GCNT1Q02742 428 aa21.8■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 PEX26Q7Z412 305 aa21.8■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 SEPT1Q8WYJ6 367 aa21.8■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 HES6Q96HZ4 224 aa21.8■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 PSMB7Q99436 277 aa21.8■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 LRRC1Q9BTT6 524 aa21.8■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 UNCXA6NJT0 531 aa21.79■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 LDHAP00338 332 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 LIG4P49917 911 aa21.79■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 SOX10P56693 466 aa21.79■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 FSTL1Q12841 308 aa21.79■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 PSMD6Q15008 389 aa21.79■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 TERF2Q15554 542 aa21.79■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 NT5DC3Q86UY8 548 aa21.79■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 RASGEF1CQ8N431 466 aa21.79■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 HELQQ8TDG4 1101 aa21.79■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 EPS8L1Q8TE68 723 aa21.79■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 BICD1Q96G01 975 aa21.79■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 OSBPP22059 807 aa21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 GLRA2P23416 452 aa21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 TNNC1P63316 161 aa21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms