RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398571.6

USP34-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene USP34, Length 11,357 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-201ENST00000398571 REEP2Q9BRK0 252 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 ZNF180Q9UJW8 692 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 CARSP49589 748 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 PARD3BQ8TEW8 1205 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 ARHGEF3Q9NR81 526 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 VGLL3A8MV65 326 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 B4DLN1 442 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 F5H6K3 240 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 SRGAP2O75044 1071 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 PHF2O75151 1096 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 CCND1P24385 295 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 KLRC3Q07444 240 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 TNIP1Q15025 636 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 GALNTL6Q49A17 601 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 CEP85LQ5SZL2 805 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 ART4Q93070 314 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 LRRN2O75325 713 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 PDE4CQ08493 712 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 PTGISQ16647 500 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 TKFCQ3LXA3 575 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 NAA35Q5VZE5 725 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 TOMM22Q9NS69 142 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 SLC24A2Q9UI40 661 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 FOXO6A8MYZ6 492 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 ADRB2P07550 413 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 GLYCTKQ8IVS8 523 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 FAM86B1E9PN63 330 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 FAM86B2P0C5J1 330 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 EPS15P42566 896 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 IRX4P78413 519 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 CIAPIN1Q6FI81 312 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 NGLY1Q96IV0 654 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 CCT8L2Q96SF2 557 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 PDLIM7Q9NR12 457 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 FSCN2O14926 492 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 INPP5BP32019 993 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 STX17P56962 302 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 SYDE2Q5VT97 1194 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 TLE6Q9H808 572 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 RXFP1Q9HBX9 757 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 SIP14410 1827 aa4.76□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.653e-6■■■■■ 63.4
USP34-201ENST00000398571 OPLAHO14841 1288 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 CALB2P22676 271 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 MNAT1P51948 309 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 SNX16P57768 344 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 C3orf67Q6ZVT6 689 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 FAM186BQ8IYM0 893 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 FBXO40Q9UH90 709 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 VAV3Q9UKW4 847 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 CTNND2Q9UQB3 1225 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 LRRC34Q8IZ02 419 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 CEP120Q8N960 986 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 PDZD7Q9H5P4 517 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 MMRN2Q9H8L6 949 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 ASIC1P78348 528 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 SPATS1Q496A3 300 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 PLCD3Q8N3E9 789 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 FBXL13Q8NEE6 735 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 CCT5P48643 541 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 GPC5P78333 572 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 XIAPP98170 497 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 ICA1Q05084 483 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 RTKN2Q8IZC4 609 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 OLFM3Q96PB7 478 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 LHX5Q9H2C1 402 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 DCLRE1BQ9H816 532 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 SLC37A4O43826 429 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 BMP3P12645 472 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 ALAS1P13196 640 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 INHBEP58166 350 aa4.75□□□□□ -1.65
USP34-201ENST00000398571 NAA20P61599 178 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms