RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 NDUFV1P49821 464 aa22.35■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 CLUL1Q15846 466 aa22.35■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 MAPK6Q16659 721 aa22.35■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.35■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 HYIQ5T013 277 aa22.35■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.35■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 HACE1Q8IYU2 909 aa22.35■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.35■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 GAD1Q99259 594 aa22.35■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.35■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 CARNS1A5YM72 827 aa22.34■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.34■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 TTLL13PA6NNM8 815 aa22.34■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 HIP1RO75146 1068 aa22.34■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 DDHD2O94830 711 aa22.34■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 MLH1P40692 756 aa22.34■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC11A1P49279 550 aa22.34■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 TMC7Q7Z402 723 aa22.34■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 CABP7Q86V35 215 aa22.34■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.34■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 USP20Q9Y2K6 914 aa22.34■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 MYH11P35749 1972 aa22.33■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 ARL5CA6NH57 179 aa22.33■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 ACKR2O00590 384 aa22.33■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 RESTQ13127 1097 aa22.33■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 DUSP6Q16828 381 aa22.33■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.33■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 DAW1Q8N136 415 aa22.33■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 IGSF21Q96ID5 467 aa22.33■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 AK8Q96MA6 479 aa22.33■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 ZFP42Q96MM3 310 aa22.33■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.33■■□□□ 1.17
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC169A6NNP5 214 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 HIDE1A8MVS5 230 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 N4BP3O15049 544 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 INPPL1O15357 1258 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 GLP2RO95838 553 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 EDN1P05305 212 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 AKAP5P24588 427 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 EFNA5P52803 228 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 PEX3P56589 373 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 SNX21Q969T3 373 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 DRC1Q96MC2 740 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM175Q9BSA9 504 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 CD207Q9UJ71 328 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 VCANP13611 3396 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 CA8P35219 290 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 UBA7P41226 1012 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 NPTX2P47972 431 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 SCNN1GP51170 649 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 GRIN1Q05586 938 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 MAPK7Q13164 816 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 VPS52Q8N1B4 723 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 MIOSQ9NXC5 875 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 KLK14Q9P0G3 267 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 CLEC1BQ9P126 229 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 PARP2Q9UGN5 583 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 MTMR6Q9Y217 621 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM50BQ9Y247 325 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 CLIC4Q9Y696 253 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 XIRP2A4UGR9 3374 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 NCOR1O75376 2440 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC26A4O43511 780 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 ALDH2P05091 517 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 PLA2G4BP0C869 781 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 GUCY2CP25092 1073 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 COLGALT2Q8IYK4 626 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 CALML4Q96GE6 196 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 TIPINQ9BVW5 301 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 ZBP1Q9H171 429 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 FSD2A1L4K1 749 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms