RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 PPP1R37O75864 691 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 GCNT3O95395 438 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 ST13P50502 369 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 CEP55Q53EZ4 464 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 PDZD8Q8NEN9 1154 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 OSCP1Q8WVF1 389 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 RASSF5Q8WWW0 418 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 S100ZQ8WXG8 99 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 CHAMP1Q96JM3 812 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 PARD6BQ9BYG5 372 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 VTI1BQ9UEU0 232 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 TJP1Q07157 1748 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 USP17L3A6NCW0 530 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 USP17L4A6NCW7 530 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 STX7O15400 261 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 SPDYAQ5MJ70 313 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 NSMFQ6X4W1 530 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC80Q76M96 950 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 USP17L1Q7RTZ2 530 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 FAM178BQ8IXR5 827 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 FANCBQ8NB91 859 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 PDPRQ8NCN5 879 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 ASZ1Q8WWH4 475 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 CCSER1Q9C0I3 900 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 TUFT1Q9NNX1 390 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 NRBP2Q9NSY0 501 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 ZFP69BQ9UJL9 534 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 TRPC5OSA6NMA1 111 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 DIAPH2O60879 1101 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 PDE8BO95263 885 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 OGNP20774 298 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 GUCY2DQ02846 1103 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 MORF4L2Q15014 288 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC184Q52MB2 194 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 ARPINQ7Z6K5 226 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 SGMS1Q86VZ5 419 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 SCYL3Q8IZE3 742 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 FBXL13Q8NEE6 735 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 GPT2Q8TD30 523 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 OSBPL10Q9BXB5 764 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC90BQ9GZT6 254 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 KANSL2Q9H9L4 492 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 KRT20P35900 424 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 RAB14P61106 215 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 INPP5DQ92835 1189 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 CRAMP1Q96RY5 1269 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 SH3BP5O60239 455 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 PDE9AO76083 593 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 GSNP06396 782 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 ARL4AP40617 200 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 USP11P51784 963 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 HIC1Q14526 733 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 KMT5BQ4FZB7 885 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 NLRP14Q86W24 1093 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 BSNDQ8WZ55 320 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 RFFLQ8WZ73 363 aa5.21□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 AP5M1Q9H0R1 490 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 LRCH1Q9Y2L9 728 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 NALCNQ8IZF0 1738 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 IRGMA1A4Y4 181 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 VGLL3A8MV65 326 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 TBC1D4O60343 1298 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 ABCB4P21439 1286 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 RPS12P25398 132 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 MARK3P27448 753 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 MDH1P40925 334 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 SPIDRQ14159 915 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 LETM2Q2VYF4 491 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 ARMCX4Q5H9R4 360 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 MOXD1Q6UVY6 613 aa5.2□□□□□ -1.58
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