RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 VARSP26640 1264 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
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RABGGTB-201ENST00000319942 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 IER5Q5VY09 327 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 C12orf56Q8IXR9 622 aa11.06□□□□□ -0.64
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RABGGTB-201ENST00000319942 ABHD10Q9NUJ1 306 aa11.05□□□□□ -0.64
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RABGGTB-201ENST00000319942 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 K7ERI5 159 aa11.04□□□□□ -0.64
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RABGGTB-201ENST00000319942 MAPK13O15264 365 aa11.04□□□□□ -0.64
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RABGGTB-201ENST00000319942 AFG1LQ8WV93 481 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 BICD1Q96G01 975 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 CEP89Q96ST8 783 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 KATNBL1Q9H079 304 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 SUGCTQ9HAC7 445 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRIQ4A6NIV6 560 aa11.02□□□□□ -0.65
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RABGGTB-201ENST00000319942 GARTP22102 1010 aa11.02□□□□□ -0.65
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