RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298317.8

RPUSD4-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-201ENST00000298317 IFT43Q96FT9 208 aa14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 NUDCD1Q96RS6 583 aa14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 RPS6KC1Q96S38 1066 aa14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 C2CD2Q9Y426 696 aa14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 TAF1P21675 1872 aa14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 TCEA3O75764 348 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 KRT18P05783 430 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 RXRBP28702 533 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 STRN3Q13033 797 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 LAMB3Q13751 1172 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 BMT2Q1RMZ1 405 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 TMEM154Q6P9G4 183 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 DNAJC9Q8WXX5 260 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 FOXO6A8MYZ6 492 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 FOXN2P32314 431 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 SETDB1Q15047 1291 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 TCEAL1Q15170 157 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 RHBDF2Q6PJF5 856 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 NCAPG2Q86XI2 1143 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 PALB2Q86YC2 1186 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 CCDC105Q8IYK2 499 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 PITPNM3Q9BZ71 974 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 LGALS13Q9UHV8 139 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 CHKBQ9Y259 395 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 NHSQ6T4R5 1651 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 CALCOCO2Q13137 446 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 GIT2Q14161 759 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 IRGCQ6NXR0 463 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 SFR1Q86XK3 245 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 VSIG1Q86XK7 387 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 CFAP61Q8NHU2 1237 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 EYA3Q99504 573 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 WHRNQ9P202 907 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 USP20Q9Y2K6 914 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 STARD13Q9Y3M8 1113 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 USP17L5A8MUK1 530 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 SETSIPP0DME0 302 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 MYBL1P10243 752 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 IMPDH2P12268 514 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 SUPT20HQ8NEM7 779 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 HAO1Q9UJM8 370 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 MAGEB2O15479 319 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 MARCH6O60337 910 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 MED24O75448 989 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 TTC4O95801 387 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 T-ENOLP0DO92 83 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 PYGBP11216 843 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 RFC4P35249 363 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 CHKAP35790 457 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 NOVP48745 357 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 MOGSQ13724 837 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 UBE2SQ16763 222 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 HHATQ5VTY9 493 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 CYP4X1Q8N118 509 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 SLCO2A1Q92959 643 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 ACTL7BQ9Y614 415 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-201ENST00000298317 USH1CQ9Y6N9 552 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms