RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 L3MBTL1Q9Y468 752 aa14.4□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 GOLGA8SH3BPF8 625 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 GOLGA8MH3BSY2 632 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 THAP12O43422 761 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 SPAG7O75391 227 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 TNNI1P19237 187 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 MARSP56192 900 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 TATDN2Q93075 761 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 CEP83Q9Y592 693 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 NFIBO00712 420 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 CYP3A4P08684 503 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 RARAP10276 462 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 MAPK4P31152 587 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 PRKCIP41743 596 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 DPH6Q7L8W6 267 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 PARP9Q8IXQ6 854 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 MREGQ8N565 214 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC63Q8NA47 563 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 WDR91A4D1P6 747 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 ERFP50548 548 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 JAM2P57087 298 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 PTENP60484 403 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 LRIG3Q6UXM1 1119 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 XXYLT1Q8NBI6 393 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 RUBCNQ92622 972 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 VCPKMTQ9H867 229 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 ODF2LQ9ULJ1 636 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 CD58P19256 250 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 ECEL1O95672 775 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 NEFHP12036 1026 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 ALDH1B1P30837 517 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 KRT17Q04695 432 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 PRKG1Q13976 671 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 Q4G0T1 1027 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 OGFOD1Q8N543 542 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 ABCF3Q9NUQ8 709 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 TRIM33Q9UPN9 1127 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 TAS1R2Q8TE23 839 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 CHST7Q9NS84 486 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 GH1P01241 217 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 STX2P32856 288 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF365Q70YC5 407 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 CD302Q8IX05 232 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 ATP8B4Q8TF62 1192 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 C11orf70Q9BRQ4 267 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 FZD1Q9UP38 647 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 EZRP15311 586 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 CYP3A7P24462 503 aa14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 PSMC4P43686 418 aa14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 FNTAP49354 379 aa14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 PDE6CP51160 858 aa14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 DYNLT1P63172 113 aa14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 DLGAP5Q15398 846 aa14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 ZSWIM1Q9BR11 485 aa14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 CARD9Q9H257 536 aa14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM120BA0PK00 339 aa14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 DENND3A2RUS2 1198 aa14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 NPR1P16066 1061 aa14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 ITGB5P18084 799 aa14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 CHKAP35790 457 aa14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 PPATQ06203 517 aa14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 RASA3Q14644 834 aa14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 TMED2Q15363 201 aa14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 DUPD1Q68J44 220 aa14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa14.36□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 CNPY4Q8N129 248 aa14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms