RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000240185.7

TARDBP-201, Transcript of TAR DNA binding protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TARDBP, Length 5,367 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBP-201ENST00000240185 TEX33O43247 280 aa14.65□□□□□ -0.06
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TARDBP-201ENST00000240185 ABI1Q8IZP0 508 aa14.65□□□□□ -0.06
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TARDBP-201ENST00000240185 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
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TARDBP-201ENST00000240185 SEC24CP53992 1094 aa14.65□□□□□ -0.06
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TARDBP-201ENST00000240185 C16orf89Q6UX73 402 aa14.65□□□□□ -0.06
TARDBP-201ENST00000240185 LRIG3Q6UXM1 1119 aa14.65□□□□□ -0.06
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TARDBP-201ENST00000240185 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TARDBP-201ENST00000240185 PRCPP42785 496 aa14.65□□□□□ -0.06
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TARDBP-201ENST00000240185 LONRF1Q17RB8 773 aa14.64□□□□□ -0.07
TARDBP-201ENST00000240185 CCDC149Q6ZUS6 474 aa14.64□□□□□ -0.07
TARDBP-201ENST00000240185 P3H2Q8IVL5 708 aa14.64□□□□□ -0.07
TARDBP-201ENST00000240185 OR6P1Q8NGX9 317 aa14.64□□□□□ -0.07
TARDBP-201ENST00000240185 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TARDBP-201ENST00000240185 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
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