RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 ALG6Q9Y672 507 aa22.77■■□□□ 1.24
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ODC1-201ENST00000234111 CALCOCO2Q13137 446 aa22.76■■□□□ 1.23
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ODC1-201ENST00000234111 GBP5Q96PP8 586 aa22.76■■□□□ 1.23
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ODC1-201ENST00000234111 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.74■■□□□ 1.23
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ODC1-201ENST00000234111 SEL1L2Q5TEA6 688 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-201ENST00000234111 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-201ENST00000234111 DTX3LQ8TDB6 740 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-201ENST00000234111 PIGSQ96S52 555 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-201ENST00000234111 ZSWIM1Q9BR11 485 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-201ENST00000234111 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
ODC1-201ENST00000234111 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-201ENST00000234111 SLIT2O94813 1529 aa22.72■■□□□ 1.23
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