RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.2■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.2■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 FAM213AQ9BRX8 229 aa20.2■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 TACC1O75410 805 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 RFC5P40937 340 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 NAMPTP43490 491 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 LIG4P49917 911 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 CAPSQ13938 189 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 KCNV1Q6PIU1 500 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 TRIM58Q8NG06 486 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 SEMA4DQ92854 862 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 KAT5Q92993 513 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 PTPN18Q99952 460 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 NAGPAQ9UK23 515 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 SAR1BQ9Y6B6 198 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 SIP14410 1827 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 UNCXA6NJT0 531 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 ZBTB42B2RXF5 422 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF185O15231 689 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 FERP16591 822 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 CYP24A1Q07973 514 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF792Q3KQV3 632 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 GPD1LQ8N335 351 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 CAPZA3Q96KX2 299 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 FUT8Q9BYC5 575 aa20.19■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.823e-10■■■■■ 27.7
SIKE1-201ENST00000060969 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 MAFO75444 373 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 LGR5O75473 907 aa20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 DLATP10515 647 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 CCNA1P78396 465 aa20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 LRRC71Q8N4P6 559 aa20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 ASB14A6NK59 587 aa20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 H0YCG3 227 aa20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 P4HA2O15460 535 aa20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 NCK2O43639 380 aa20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 GARTP22102 1010 aa20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 WNT7BP56706 349 aa20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 CETN1Q12798 172 aa20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 STRN3Q13033 797 aa20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 PLCB4Q15147 1175 aa20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 LONRF2Q1L5Z9 754 aa20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 TAF3Q5VWG9 929 aa20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 SPRYD7Q5W111 196 aa20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 RAB21Q9UL25 225 aa20.18■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 ANO9A1A5B4 782 aa20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 TTLL13PA6NNM8 815 aa20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 K7ERI5 159 aa20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 TTLL4Q14679 1199 aa20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 NAB2Q15742 525 aa20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 C2orf69Q8N8R5 385 aa20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 NOX5Q96PH1 765 aa20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 NENFQ9UMX5 172 aa20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 ACOT2P49753 483 aa20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 FKBP1BP68106 108 aa20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 TAS1R2Q8TE23 839 aa20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 SCFD2Q8WU76 684 aa20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 FAM167AQ96KS9 214 aa20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 ALS2CR12Q96Q35 445 aa20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 PSMB7Q99436 277 aa20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 JRKLQ9Y4A0 524 aa20.17■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 CCDC66A2RUB6 948 aa20.16■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 CTAGE15A4D2H0 777 aa20.16■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 CTAGE8P0CG41 777 aa20.16■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 KRT39Q6A163 491 aa20.16■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 TAPT1Q6NXT6 567 aa20.16■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa20.16■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 CTAGE6Q86UF2 777 aa20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms