RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP3K14	Q99558	947 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	RASSF1	Q9NS23	344 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	L1RE1	Q9UN81	338 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	STRC	Q7RTU9	1775 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616		H3BML4	177 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	EYA2	O00167	538 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	CD3E	P07766	207 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	GSTM1	P09488	218 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	GRK2	P25098	689 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	PEX2	P28328	305 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	PIK3CB	P42338	1070 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	SCRN1	Q12765	414 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	PPFIA1	Q13136	1202 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	ARMC3	Q5W041	872 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	ZPBP2	Q6X784	338 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	ORAI2	Q96SN7	254 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	CENPO	Q9BU64	300 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCC11	Q96J66	1382 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	ALK	Q9UM73	1620 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC66	A2RUB6	948 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	LCHN	A4D1U4	455 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	AURKA	O14965	403 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	B3GALT2	O43825	422 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	ORC4	O43929	436 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	MBD4	O95243	580 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	IFNGR1	P15260	489 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	PHC1	P78364	1004 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	MPP1	Q00013	466 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	NUCB1	Q02818	461 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	PAK1	Q13153	545 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	PRR16	Q569H4	304 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	LBX2	Q6XYB7	198 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	DENND1C	Q8IV53	801 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	ABI1	Q8IZP0	508 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	FRS2	Q8WU20	508 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	MVB12A	Q96EY5	273 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR27	Q9NS67	375 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		5.84	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	IQGAP1	P46940	1657 aa		5.84	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	TECPR2	O15040	1411 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A087WV62	115 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	GOLIM4	O00461	696 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	WNT9A	O14904	365 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	NCK2	O43639	380 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	UBXN7	O94888	489 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CD4	P01730	458 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	THBD	P07204	575 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	TNFSF4	P23510	183 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	DNM2	P50570	870 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF220	Q5VTB9	566 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	DPP9	Q86TI2	863 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	5.83	□□□□□ -1.48

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