RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595749.1

FCHO1-211, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-211ENST00000595749 TEX28O15482 410 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 ZBTB43O43298 467 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 LAMP2P13473 410 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 SDHBP21912 280 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 SFNP31947 248 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 CIITAP33076 1130 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 STARD6P59095 220 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 HTR4Q13639 388 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 MTERF2Q49AM1 385 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 CREB3L3Q68CJ9 461 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 TAS1R1Q7RTX1 841 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 RHPN2Q8IUC4 686 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 LENG9Q96B70 501 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 BORCS6Q96GS4 357 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 PIDD1Q9HB75 910 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 KANSL3Q9P2N6 904 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 NCDNQ9UBB6 729 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 BRPF3Q9ULD4 1205 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 ESYT2A0FGR8 921 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 CHMP2AO43633 222 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 LRRN2O75325 713 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 PAPLNO95428 1278 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 POMCP01189 267 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 SPATA31D3P0C874 917 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 GLUD2P49448 558 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 JAK3P52333 1124 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 NECTIN1Q15223 517 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 ZNF528Q3MIS6 628 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 HDAC7Q8WUI4 952 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 SHDQ96IW2 340 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 CEP89Q96ST8 783 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 RIT2Q99578 217 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 ZMYND12Q9H0C1 365 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 UNC45AQ9H3U1 944 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 RSAD1Q9HA92 442 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 RXFP1Q9HBX9 757 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 C6orf50Q9HD87 102 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 NUMBLQ9Y6R0 609 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-211ENST00000595749 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 TMEM150BA6NC51 233 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 GOLGA8AA7E2F4 631 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 GOLGA8BA8MQT2 603 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 SPTLC1O15269 473 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 MSH4O15457 936 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 GAS7O60861 476 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 CDC27P30260 824 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 XKR3Q5GH77 459 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 KIAA0319Q5VV43 1072 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 KSR1Q8IVT5 923 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 PHKBQ93100 1093 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 NLRP4Q96MN2 994 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 SH2D3AQ9BRG2 576 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 TEKT3Q9BXF9 490 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 NT5C3AQ9H0P0 336 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 MARCH5Q9NX47 278 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 FBXO4Q9UKT5 387 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 LAMTOR5O43504 91 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 GAS2O43903 313 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 STBD1O95210 358 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 EFEMP2O95967 443 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 OR1G1P47890 313 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 GPC5P78333 572 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 DSG1Q02413 1049 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 LRCH2Q5VUJ6 765 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 PALB2Q86YC2 1186 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 COLGALT2Q8IYK4 626 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 RDM1Q8NG50 284 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 SLC5A5Q92911 643 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 CCDC136Q96JN2 1154 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 BCO2Q9BYV7 579 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 PRKD2Q9BZL6 878 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-211ENST00000595749 IFT122Q9HBG6 1241 aa13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms