RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 C16orf70Q9BSU1 422 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 TMX1Q9H3N1 280 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 ABHD10Q9NUJ1 306 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 MGAMO43451 1857 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 TUBB4AP04350 444 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 EXOC3L4Q17RC7 722 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 NFKBIZQ9BYH8 718 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 NRCAMQ92823 1304 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 C22orf31O95567 290 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF286BP0CG31 522 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 KLRC1P26715 233 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 VAMP7P51809 220 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 PRMT2P55345 433 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 SOX10P56693 466 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 CAPSQ13938 189 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 CCL14Q16627 93 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 GPD1LQ8N335 351 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 ERO1AQ96HE7 468 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 RNPEPQ9H4A4 650 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 PLCB1Q9NQ66 1216 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 KCND1Q9NSA2 647 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 SAGE1Q9NXZ1 904 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 FLRT1Q9NZU1 646 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 CEP72Q9P209 647 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF233A6NK53 670 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 TRPA1O75762 1119 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 RFX1P22670 979 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 CLCN1P35523 988 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 FLT3LGP49771 235 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 IGBP1P78318 339 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 ARID5BQ14865 1188 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 GRIK4Q16099 956 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 RHPN2Q8IUC4 686 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 TXLNBQ8N3L3 684 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF149Q8NC42 400 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 TMC2Q8TDI7 906 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC35C1Q96A29 364 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 KIFC3Q9BVG8 833 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 PCIF1Q9H4Z3 704 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 PYCARDQ9ULZ3 195 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 SIK3Q9Y2K2 1263 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 TTC26A0AVF1 554 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB42B2RXF5 422 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 EXTL3O43909 919 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 F2P00734 622 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 RARBP10826 455 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 GTF2H1P32780 548 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 CASP4P49662 377 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 MTHFD1LQ6UB35 978 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAJC7Q99615 494 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 MYO6Q9UM54 1294 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 AKT3Q9Y243 479 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 TBC1D8O95759 1140 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHA2P01877 340 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 PRKCBP05771 671 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 MYL3P08590 195 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC172P0C7W6 258 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 MYL7Q01449 175 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP24.64■■□□□ 1.542e-6■■■□□ 17.3
CAPNS1-212ENST00000591041 SURF1Q15526 300 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 KYAT1Q16773 422 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF410Q86VK4 478 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 BORCS6Q96GS4 357 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 SCLT1Q96NL6 688 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 CBWD1Q9BRT8 395 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 SPTLC3Q9NUV7 552 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXL5Q9UKA1 691 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 STYXL1Q9Y6J8 313 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-212ENST00000591041 PMM2O15305 246 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 SEPT4O43236 478 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 FMO5P49326 533 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 PSEN2P49810 448 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 CDK17Q00537 523 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 MFSD10Q14728 455 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM63BQ5T3F8 832 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC170Q8IYT3 715 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC71Q8N4P6 559 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM81BQ96LP2 452 aa24.63■■□□□ 1.53
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