RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589104.5

KDM4B-208, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

TSL 2

Gene KDM4B, Length 3,470 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-208ENST00000589104 DACT2Q5SW24 774 aa14.51□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.51□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 CGB2Q6NT52 195 aa14.51□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa14.51□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 JAMLQ86YT9 394 aa14.51□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 THAP2Q9H0W7 228 aa14.51□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.51□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 MEIS1O00470 390 aa14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 CAND2O75155 1236 aa14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 MAATS1Q7Z4T9 603 aa14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 DNM3Q9UQ16 869 aa14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 CNTNAP1P78357 1384 aa14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 A0A1W2PRG0 241 aa14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 GJB6O95452 261 aa14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 SLURP2P0DP57 97 aa14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 RPL21P46778 160 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 NCKAP1LP55160 1127 aa14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 MICALCLQ6ZW33 695 aa14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 KLC4Q9NSK0 619 aa14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 CAPN7Q9Y6W3 813 aa14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 KRIT1O00522 736 aa14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 FSCN2O14926 492 aa14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 CHRNA3P32297 505 aa14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 SLC27A3Q5K4L6 730 aa14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 RHOT2Q8IXI1 618 aa14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 IFT81Q8WYA0 676 aa14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 AMNQ9BXJ7 453 aa14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 TRPC6Q9Y210 931 aa14.5□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 ANKRD63C9JTQ0 380 aa14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 AGTP01019 485 aa14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 GTF2BQ00403 316 aa14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 BFSP1Q12934 665 aa14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 VSTM1Q6UX27 236 aa14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 CEP57Q86XR8 500 aa14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 RIPK2O43353 540 aa14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 POTEJP0CG39 1038 aa14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 TMOD1P28289 359 aa14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 NF2P35240 595 aa14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 FAM196AQ6ZSG2 479 aa14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 AGPAT1Q99943 283 aa14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 TRIM51Q9BSJ1 452 aa14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 NDUFB10O96000 172 aa14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 SLC18A1P54219 525 aa14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 PEX26Q7Z412 305 aa14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 KLHL7Q8IXQ5 586 aa14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 EPS8L1Q8TE68 723 aa14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 SHC3Q92529 594 aa14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.49□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 MAGEB2O15479 319 aa14.48□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 STBD1O95210 358 aa14.48□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 RARGP13631 454 aa14.48□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 CNGA2Q16280 664 aa14.48□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.48□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 GLYCTKQ8IVS8 523 aa14.48□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 CCDC26Q8TAB7 109 aa14.48□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 RAB17Q9H0T7 212 aa14.48□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 CCNB1P14635 433 aa14.48□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 RGS9BPQ6ZS82 235 aa14.48□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 ARHGEF19Q8IW93 802 aa14.48□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 ERMNQ8TAM6 284 aa14.48□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 KRT35Q92764 455 aa14.48□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 CHMP6Q96FZ7 201 aa14.48□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.48□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 CEP104O60308 925 aa14.47□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 FGGP02679 453 aa14.47□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 RXRBP28702 533 aa14.47□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 MARCKSL1P49006 195 aa14.47□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 DR1Q01658 176 aa14.47□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 SPP2Q13103 211 aa14.47□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 FAM186BQ8IYM0 893 aa14.47□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 HELQQ8TDG4 1101 aa14.47□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 FMO2Q99518 471 aa14.47□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.47□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 USP40Q9NVE5 1235 aa14.47□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 AMFRQ9UKV5 643 aa14.47□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.47□□□□□ -0.09
KDM4B-208ENST00000589104 TMCO5BA8MYB1 307 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms