RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567316.1

CTU2-209, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTU2, Length 452 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-209ENST00000567316 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa16.95■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 MAP4K3Q8IVH8 894 aa16.95■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 C7orf61Q8IZ16 206 aa16.95■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 P2RX5Q93086 422 aa16.95■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 TOX2Q96NM4 488 aa16.95■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 FZD8Q9H461 694 aa16.95■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 TMEM206Q9H813 350 aa16.95■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 GINS2Q9Y248 185 aa16.95■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 LTBP2Q14767 1821 aa16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 TRIM49BA6NDI0 452 aa16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 M0QZ92 97 aa16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 TGFB1I1O43294 461 aa16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 CAND2O75155 1236 aa16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 CAVIN2O95810 425 aa16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 PRKCBP05771 671 aa16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 CTSHP09668 335 aa16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 IQCF3P0C7M6 154 aa16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 CKBP12277 381 aa16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 DARSP14868 501 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 ZNF165P49910 485 aa16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 RBL2Q08999 1139 aa16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 STRN3Q13033 797 aa16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 MAPK6Q16659 721 aa16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 FAM187BQ17R55 369 aa16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 ANKRD40Q6AI12 368 aa16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 BPIFA3Q9BQP9 254 aa16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 PRO3102Q9H379 93 aa16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 CBX8Q9HC52 389 aa16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 RWDD2AQ9UIY3 292 aa16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 EXOC7Q9UPT5 735 aa16.94■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 DCDC2CA8MYV0 355 aa16.93■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 FAAP100Q0VG06 881 aa16.93■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 IQCB1Q15051 598 aa16.93■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 ZCWPW2Q504Y3 356 aa16.93■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 ZNF618Q5T7W0 954 aa16.93■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 TTI2Q6NXR4 508 aa16.93■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 TRAF7Q6Q0C0 670 aa16.93■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.93■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 SYCP3Q8IZU3 236 aa16.93■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 CCDC155Q8N6L0 562 aa16.93■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 CAGE1Q8TC20 777 aa16.93■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 TMEM40Q8WWA1 233 aa16.93■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa16.93■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 USP20Q9Y2K6 914 aa16.93■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 BICDL2A1A5D9 508 aa16.92■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 TTLL13PA6NNM8 815 aa16.92■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 ANKRD63C9JTQ0 380 aa16.92■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 ACKR2O00590 384 aa16.92■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 PDXKO00764 312 aa16.92■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 PIGRP01833 764 aa16.92■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 FGFR4P22455 802 aa16.92■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 AMHR2Q16671 573 aa16.92■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 SLC39A4Q6P5W5 647 aa16.92■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 FOXR2Q6PJQ5 311 aa16.92■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 AOPEPQ8N6M6 819 aa16.92■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 FAM200AQ8TCP9 573 aa16.92■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 GBP3Q9H0R5 595 aa16.92■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa16.92■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 TISP43B9A030 160 aa16.91■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 CLIC2O15247 247 aa16.91■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 B4GALT5O43286 388 aa16.91■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 CALUO43852 315 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 BMP8BP34820 402 aa16.91■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 LRRC63Q05C16 580 aa16.91■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 BFSP2Q13515 415 aa16.91■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 BICD1Q96G01 975 aa16.91■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 PRIMPOLQ96LW4 560 aa16.91■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 TSG101Q99816 390 aa16.91■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 GDF15Q99988 308 aa16.91■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 OSBPL7Q9BZF2 842 aa16.91■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 RBSNQ9H1K0 784 aa16.91■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa16.9■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 IKBKBO14920 756 aa16.9■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 SELPP16109 830 aa16.9■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 LIG4P49917 911 aa16.9■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 MYL5Q02045 173 aa16.9■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 NCAPHQ15003 741 aa16.9■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP16.9■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 NFIL3Q16649 462 aa16.9■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 EDRF1Q3B7T1 1238 aa16.9■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CTU2-209ENST00000567316 FBXO47Q5MNV8 452 aa16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms