RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567087.5

PKM-218, Transcript of pyruvate kinase M1/2, humanhuman

TSL 4

Gene PKM, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKM-218ENST00000567087 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 XIRP2A4UGR9 3374 aa20.54■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 MYO7AQ13402 2215 aa20.53■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 PDCP20941 246 aa20.53■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 NRIP1P48552 1158 aa20.53■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 NDUFV1P49821 464 aa20.53■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 BCAR1P56945 870 aa20.53■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 PPP2R5AQ15172 486 aa20.53■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 UBXN11Q5T124 520 aa20.53■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.53■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.53■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 CPB2Q96IY4 423 aa20.53■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 TCF25Q9BQ70 676 aa20.53■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 CSRNP2Q9H175 543 aa20.53■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 TLE6Q9H808 572 aa20.53■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 UBN1Q9NPG3 1134 aa20.53■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.53■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 MEIS3P2A8K0S8 358 aa20.52■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 OFD1O75665 1012 aa20.52■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 ITGA4P13612 1032 aa20.52■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.885e-11■■■■□ 24
PKM-218ENST00000567087 CUL4AQ13619 759 aa20.52■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 ECM1Q16610 540 aa20.52■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.52■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.52■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.52■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 BRAPQ7Z569 592 aa20.52■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 EFHBQ8N7U6 833 aa20.52■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 DEPTORQ8TB45 409 aa20.52■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 KIFAP3Q92845 792 aa20.52■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 TMEM169Q96HH4 297 aa20.52■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 IFT74Q96LB3 600 aa20.52■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.52■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 GBP3Q9H0R5 595 aa20.52■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 KANSL3Q9P2N6 904 aa20.52■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 DNM3Q9UQ16 869 aa20.52■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.52■□□□□ 0.88
PKM-218ENST00000567087 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa20.51■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 PP2D1A8MPX8 630 aa20.51■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 FSCN2O14926 492 aa20.51■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 NAMPTP43490 491 aa20.51■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 ERVFC1P60507 584 aa20.51■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 AMHR2Q16671 573 aa20.51■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 AGMOQ6ZNB7 445 aa20.51■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 IPPQ9Y573 584 aa20.51■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa20.51■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 GRXCR2A6NFK2 248 aa20.5■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 LINC01565O15544 149 aa20.5■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 B4GALT5O43286 388 aa20.5■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 EYA4O95677 639 aa20.5■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 BMP15O95972 392 aa20.5■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 SRGAP2BP0DMP2 458 aa20.5■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 ADAM15Q13444 863 aa20.5■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 IL17AQ16552 155 aa20.5■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 MAPK6Q16659 721 aa20.5■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 SLC27A1Q6PCB7 646 aa20.5■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.5■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 TMC7Q7Z402 723 aa20.5■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.5■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.5■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 VWA3AA6NCI4 1184 aa20.49■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.49■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 TBX10O75333 385 aa20.49■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 IL9P15248 144 aa20.49■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 LTBRP36941 435 aa20.49■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 CLUL1Q15846 466 aa20.49■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 BSNDQ8WZ55 320 aa20.49■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 APOL6Q9BWW8 343 aa20.49■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 CD207Q9UJ71 328 aa20.49■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 E9PMD0 336 aa20.48■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 NPTXRO95502 500 aa20.48■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 PRKCBP05771 671 aa20.48■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 LIG1P18858 919 aa20.48■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 CDC25AP30304 524 aa20.48■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 CA8P35219 290 aa20.48■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 EFNA5P52803 228 aa20.48■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 DUSP6Q16828 381 aa20.48■□□□□ 0.87
PKM-218ENST00000567087 FAM187BQ17R55 369 aa20.48■□□□□ 0.87
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