RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561293.5

MEIS3-212, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS3, Length 1,918 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-212ENST00000561293 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
MEIS3-212ENST00000561293 LRRC27Q9C0I9 530 aa23.33■■□□□ 1.33
MEIS3-212ENST00000561293 EXOC1Q9NV70 894 aa23.33■■□□□ 1.33
MEIS3-212ENST00000561293 GPR182O15218 404 aa23.33■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 FAM26FQ5R3K3 315 aa23.33■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 NT5DC1Q5TFE4 455 aa23.33■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 EEF1DP3Q658K8 133 aa23.33■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 NELFCDQ8IXH7 590 aa23.33■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 KIAA0895Q8NCT3 520 aa23.33■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 SPIRE2Q8WWL2 714 aa23.33■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 TIGD1Q96MW7 591 aa23.33■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 FZD8Q9H461 694 aa23.33■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 RNF19AQ9NV58 838 aa23.33■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 HES2Q9Y543 173 aa23.33■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa23.33■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 MEIS3P2A8K0S8 358 aa23.32■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 UPP2O95045 317 aa23.32■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 HARSP12081 509 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 EHHADHQ08426 723 aa23.32■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.32■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 RNF169Q8NCN4 708 aa23.32■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 C17orf75Q9HAS0 396 aa23.32■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa23.32■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 GRXCR1A8MXD5 290 aa23.31■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 RFC2P35250 354 aa23.31■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 CDC42EP1Q00587 391 aa23.31■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 SEZ6Q53EL9 994 aa23.31■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 ZBTB33Q86T24 672 aa23.31■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 MYOCDQ8IZQ8 938 aa23.31■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 NFKBIZQ9BYH8 718 aa23.31■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 TBX20Q9UMR3 447 aa23.31■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 GAP43P17677 238 aa23.31■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 CNNM4Q6P4Q7 775 aa23.31■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 C2orf40Q9H1Z8 148 aa23.31■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 CLSTN2Q9H4D0 955 aa23.31■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa23.31■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa23.3■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 ENPP3O14638 875 aa23.3■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 HOXD13P35453 343 aa23.3■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 POU5F1BQ06416 359 aa23.3■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 IKBKEQ14164 716 aa23.3■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 KANK3Q6NY19 840 aa23.3■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 LPPQ93052 612 aa23.3■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 BICD1Q96G01 975 aa23.3■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 GATMP50440 423 aa23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 WDR5P61964 334 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 USP38Q8NB14 1042 aa23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 SMARCE1Q969G3 411 aa23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 APOL6Q9BWW8 343 aa23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 HAPLN2Q9GZV7 340 aa23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 PDZD7Q9H5P4 517 aa23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 OLFML3Q9NRN5 406 aa23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 ANKRD63C9JTQ0 380 aa23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 ACKR2O00590 384 aa23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 PPP1R37O75864 691 aa23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 EFNA5P52803 228 aa23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 DSC3Q14574 896 aa23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 NFKBIBQ15653 356 aa23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 SLC39A4Q6P5W5 647 aa23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 CEP120Q8N960 986 aa23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 SCFD1Q8WVM8 642 aa23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 TMEM63CQ9P1W3 806 aa23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 CHD7Q9P2D1 2997 aa23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 MAN1B1Q9UKM7 699 aa23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 PARNO95453 639 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 NPTXRO95502 500 aa23.28■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 BMP6P22004 513 aa23.28■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 OSTNP61366 133 aa23.28■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 GTF2BQ00403 316 aa23.28■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 STRN3Q13033 797 aa23.28■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 UBXN11Q5T124 520 aa23.28■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa23.28■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 STRA6Q9BX79 667 aa23.28■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 SQORQ9Y6N5 450 aa23.28■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa23.28■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 ATF7IP2Q5U623 682 aa23.27■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 RNF39Q9H2S5 420 aa23.27■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 TMEM134Q9H6X4 195 aa23.27■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 SEL1LQ9UBV2 794 aa23.27■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 RABGGTBP53611 331 aa23.27■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 TMEM192Q8IY95 271 aa23.27■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 CXCL16Q9H2A7 254 aa23.27■■□□□ 1.32
MEIS3-212ENST00000561293 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms