RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558078.5

TTC23-212, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 23, humanhuman

TSL 4

Gene TTC23, Length 574 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC23-212ENST00000558078 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 BICRALQ6AI39 1079 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 TTLL10Q6ZVT0 673 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 MIGA2Q7L4E1 593 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 GUCD1Q96NT3 240 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 STRIP2Q9ULQ0 834 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 AKT3Q9Y243 479 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 MAST3O60307 1309 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 CXCL11O14625 94 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 HMGCRP04035 888 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 ZNF853P0CG23 659 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 BMP7P18075 431 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 MAPKAPK2P49137 400 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 AMPD2Q01433 879 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 UBE4AQ14139 1066 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 NR1I3Q14994 352 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 VMACQ2NL98 169 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 CCDC57Q2TAC2 916 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 OLFML2BQ68BL8 750 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 PAQR3Q6TCH7 311 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 C8orf58Q8NAV2 365 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 APBA2Q99767 749 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 RXFP1Q9HBX9 757 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 A0A1W2PQJ5 194 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 CYBBP04839 570 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 TPM2P07951 284 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 INHBBP09529 407 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 SEPHS1P49903 392 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 RBM10P98175 930 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 TMEM62Q0P6H9 643 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 MOGSQ13724 837 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 FAM129CQ86XR2 697 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 FAM151AQ8WW52 585 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 CAPN10Q9HC96 672 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 BACE2Q9Y5Z0 518 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 DOCK3Q8IZD9 2030 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 SRGAP3O43295 1099 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 KCNH1O95259 989 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 ETFBP38117 255 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 PRR5P85299 388 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 TCP10Q12799 353 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 GRB10Q13322 594 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 RALBP1Q15311 655 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 CAVIN4Q5BKX8 364 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 LMBR1LQ6UX01 489 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 BVESQ8NE79 360 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 LINS1Q8NG48 757 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 DNAAF4Q8WXU2 420 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 PDCL3Q9H2J4 239 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 ZNF112Q9UJU3 913 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 RWDD3Q9Y3V2 267 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 ZHX2Q9Y6X8 837 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 BDP1A6H8Y1 2624 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 MYH13Q9UKX3 1938 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 DOCK2Q92608 1830 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 RFXAPO00287 272 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 TRIM13O60858 407 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 CORO7P57737 925 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 FOXO4P98177 505 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 CYP4F3Q08477 520 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 G2E3Q7L622 706 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 FAM122AQ96E09 287 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 C20orf173Q96LM9 149 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 MTA3Q9BTC8 594 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 BCAS3Q9H6U6 928 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 GULP1Q9UBP9 304 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 OGDHLQ9ULD0 1010 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 PTPRFP10586 1907 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC23-212ENST00000558078 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
TTC23-212ENST00000558078 PFASO15067 1338 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC23-212ENST00000558078 DOCK1Q14185 1865 aa7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms