RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557464.5

RBM23-230, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 5

Gene RBM23, Length 457 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-230	ENST00000557464	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	BSND	Q8WZ55	320 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	ZNF558	Q96NG5	402 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	TNFRSF10A	O00220	468 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	BCAR1	P56945	870 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	PLCB3	Q01970	1234 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	ADAM15	Q13444	863 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	KCNK18	Q7Z418	384 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	PGBD4	Q96DM1	585 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	RAB34	Q9BZG1	259 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	TLR9	Q9NR96	1032 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	SPG21	Q9NZD8	308 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	HES2	Q9Y543	173 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	PER2	O15055	1255 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	NCK2	O43639	380 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	B4GALT3	O60512	393 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	IL9	P15248	144 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	AXL	P30530	894 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	NRIP1	P48552	1158 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	CLUL1	Q15846	466 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	KRT79	Q5XKE5	535 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	NOTUM	Q6P988	496 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	GBP3	Q9H0R5	595 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	CSRNP2	Q9H175	543 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	RSAD1	Q9HA92	442 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	LZTS1	Q9Y250	596 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	USP20	Q9Y2K6	914 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	IPP	Q9Y573	584 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	FSCN2	O14926	492 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	TBX10	O75333	385 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	DDHD2	O94830	711 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	EYA4	O95677	639 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	GALT	P07902	379 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	ITGA4	P13612	1032 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	KRT17	Q04695	432 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	PNMA5	Q96PV4	448 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	PLIN2	Q99541	437 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	APOL6	Q9BWW8	343 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	FZD8	Q9H461	694 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	TLE6	Q9H808	572 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	MIOS	Q9NXC5	875 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	DNM3	Q9UQ16	869 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	STK24	Q9Y6E0	443 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464		A0A1B0GUA9	196 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	HIDE1	A8MVS5	230 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	NPTXR	O95502	500 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	POMC	P01189	267 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	EDN1	P05305	212 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	LIG1	P18858	919 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	PPM1A	P35813	382 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	NAMPT	P43490	491 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	SLC11A1	P49279	550 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	TMC7	Q7Z402	723 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	EFHB	Q8N7U6	833 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-230	ENST00000557464	CNNM3	Q8NE01	707 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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