RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552160.2

BICD1-208, Transcript of BICD cargo adaptor 1, human

TSL 1 (best)

Gene BICD1, Length 1,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BICD1-208	ENST00000552160	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	WASF3	Q9UPY6	502 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	ACOT7	O00154	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	PCDH8	O95206	1070 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	MYB	P10242	640 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	RAC2	P15153	192 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	PNLIP	P16233	465 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	NFATC3	Q12968	1075 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	ADRM1	Q16186	407 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	ALF	Q53S48	1182 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	CCT6B	Q92526	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	DDX11	Q96FC9	970 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	FAM167A	Q96KS9	214 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	PTPN18	Q99952	460 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	MTG2	Q9H4K7	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	DTL	Q9NZJ0	730 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	IPP	Q9Y573	584 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BICD1-208	ENST00000552160		A0A088AWK7	358 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	SGTA	O43765	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	TGFB1	P01137	390 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	ALDH2	P05091	517 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	MSL3P1	P0C860	447 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	GRIN1	Q05586	938 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	TICAM2	Q86XR7	235 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	TEX19	Q8NA77	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	POF1B	Q8WVV4	589 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	RGMA	Q96B86	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	TBCB	Q99426	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	INCENP	Q9NQS7	918 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	LUZP4	Q9P127	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	BTBD7	Q9P203	1132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	PNMA2	Q9UL42	364 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	USP18	Q9UMW8	372 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	TOP2B	Q02880	1626 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	CUTA	O60888	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	OPHN1	O60890	802 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	DBH	P09172	617 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	MCAM	P43121	646 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	HK2	P52789	917 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	MGAT2	Q10469	447 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	NRG4	Q8WWG1	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	PHKB	Q93100	1093 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	APIP	Q96GX9	242 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	BTBD2	Q9BX70	525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	EBF1	Q9UH73	591 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	ADAMTS12	P58397	1594 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160		A0A0A6YYJ9	748 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160		F8W031	263 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	NBN	O60934	754 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	PHF2	O75151	1096 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BICD1-208	ENST00000552160	ADAMTS4	O75173	837 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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