RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 DNM1LO00429 736 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 PDXKO00764 312 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 CLIC2O15247 247 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 CLDN3O15551 220 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 RPS6KA5O75582 802 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 VTNP04004 478 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 MYBP10242 640 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 UBASH3AP57075 661 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 KYAT1Q16773 422 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF720Q7Z2F6 126 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 ZBTB33Q86T24 672 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 RDH13Q8NBN7 331 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 LMBR1Q8WVP7 490 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 DNAJC19Q96DA6 116 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 MSTO1Q9BUK6 570 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 TBX20Q9UMR3 447 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 TRPV2Q9Y5S1 764 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 A0A087WZ62 844 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 SGPL1O95470 568 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 CST5P28325 142 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 SOX10P56693 466 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 MTFR1Q15390 333 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 SURF1Q15526 300 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 KIZQ2M2Z5 673 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 ARSHQ5FYA8 562 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 RNF169Q8NCN4 708 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 CEP63Q96MT8 703 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 MMRN2Q9H8L6 949 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF233A6NK53 670 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 GPR182O15218 404 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 NR3C1P04150 777 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 NDUFV2P19404 249 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 PTGS1P23219 599 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 GLRA2P23416 452 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 FAM186BQ8IYM0 893 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 XXYLT1Q8NBI6 393 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 THAP9Q9H5L6 903 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 KCNJ18B7U540 433 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 ARVCFO00192 962 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 C22orf31O95567 290 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 KCNA1Q09470 495 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 BIRC3Q13489 604 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 KCNJ12Q14500 433 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 BPIFA3Q9BQP9 254 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 C11orf49Q9H6J7 331 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM134Q9H6X4 195 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 FANCLQ9NW38 375 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 PARP2Q9UGN5 583 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 MYADML2A6NDP7 307 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 TREHO43280 583 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 XPOTO43592 962 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 ATP4AP20648 1035 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 ARL2P36404 184 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 PAK2Q13177 524 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 PTK7Q13308 1070 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 ATF7IP2Q5U623 682 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 RBSNQ9H1K0 784 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 A0A1W2PQY0 241 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 KLRC4O43908 158 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRO-210ENST00000544244 OFD1O75665 1012 aa6.18□□□□□ -1.42
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