RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534143.5

CMTM1-220, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 781 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-220ENST00000534143 LRWD1Q9UFC0 647 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 J3QW42 95 aa6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 GAS7O60861 476 aa6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 ADAM23O75077 832 aa6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 CCNE2O96020 404 aa6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 RGS2P41220 211 aa6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 UBA7P41226 1012 aa6.86□□□□□ -1.31
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CMTM1-220ENST00000534143 GRB10Q13322 594 aa6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 KARSQ15046 597 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 EPHA7Q15375 998 aa6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 ECM1Q16610 540 aa6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 LONRF3Q496Y0 759 aa6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 TMEM119Q4V9L6 283 aa6.86□□□□□ -1.31
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CMTM1-220ENST00000534143 OLFML2BQ68BL8 750 aa6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
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CMTM1-220ENST00000534143 KRBA2Q6ZNG9 492 aa6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 SEPT14Q6ZU15 432 aa6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 LRRC15Q8TF66 581 aa6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 PANK2Q9BZ23 570 aa6.86□□□□□ -1.31
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CMTM1-220ENST00000534143 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 VTA1Q9NP79 307 aa6.86□□□□□ -1.31
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CMTM1-220ENST00000534143 FLRT1Q9NZU1 646 aa6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 USP25Q9UHP3 1055 aa6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 GABRQQ9UN88 632 aa6.86□□□□□ -1.31
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CMTM1-220ENST00000534143 MED24O75448 989 aa6.85□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 SLITRK3O94933 977 aa6.85□□□□□ -1.31
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CMTM1-220ENST00000534143 GHRHP01286 108 aa6.85□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 SLFN14P0C7P3 912 aa6.85□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 ELNP15502 786 aa6.85□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 CYP2B6P20813 491 aa6.85□□□□□ -1.31
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CMTM1-220ENST00000534143 FLT3LGP49771 235 aa6.85□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 TERF1P54274 439 aa6.85□□□□□ -1.31
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CMTM1-220ENST00000534143 TMEM63BQ5T3F8 832 aa6.85□□□□□ -1.31
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CMTM1-220ENST00000534143 RDM1Q8NG50 284 aa6.85□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 OR13H1Q8NG92 308 aa6.85□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.85□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.85□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 DHX58Q96C10 678 aa6.85□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 APBA2Q99767 749 aa6.85□□□□□ -1.31
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CMTM1-220ENST00000534143 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
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CMTM1-220ENST00000534143 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.85□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 TUFT1Q9NNX1 390 aa6.85□□□□□ -1.31
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CMTM1-220ENST00000534143 DISC1Q9NRI5 854 aa6.85□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa6.85□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 RGL1Q9NZL6 768 aa6.85□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 CCDC39Q9UFE4 941 aa6.85□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.85□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa6.84□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa6.84□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa6.84□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 CARNS1A5YM72 827 aa6.84□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 CTAGE5O15320 804 aa6.84□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 FKTNO75072 461 aa6.84□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 LYPLA2O95372 231 aa6.84□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 GGPS1O95749 300 aa6.84□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
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