RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530238.5

BRMS1-207, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 5

Gene BRMS1, Length 1,817 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-207ENST00000530238 EPN3Q9H201 632 aa25.07■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 VCPKMTQ9H867 229 aa25.07■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 GGA2Q9UJY4 613 aa25.07■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.07■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 FAM187AA6NFU0 413 aa25.07■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 NDUFAB1O14561 156 aa25.07■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 GBP1P32455 592 aa25.07■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 CYP2J2P51589 502 aa25.07■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 MAP3K10Q02779 954 aa25.07■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 MORC4Q8TE76 937 aa25.07■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 TEPSINQ96N21 525 aa25.07■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 LXNQ9BS40 222 aa25.07■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.07■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.06■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 PMM2O15305 246 aa25.06■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 C11orf63Q6NUN7 778 aa25.06■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 IWS1Q96ST2 819 aa25.06■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 MXRA8Q9BRK3 442 aa25.06■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 AP1M1Q9BXS5 423 aa25.06■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 GPR88Q9GZN0 384 aa25.06■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 LSP1P33241 339 aa25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 MDH1P40925 334 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 PTENP60484 403 aa25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 PDCLQ13371 301 aa25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 CBWD6Q4V339 395 aa25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 CBWD3Q5JTY5 395 aa25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 CBWD5Q5RIA9 395 aa25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 CCDC174Q6PII3 467 aa25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 TADA2BQ86TJ2 420 aa25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 ACCSQ96QU6 501 aa25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 USP20Q9Y2K6 914 aa25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 FAM169AQ9Y6X4 670 aa25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 HIP1RO75146 1068 aa25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 ECE1P42892 770 aa25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 TNFAIP1Q13829 316 aa25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 PLS1Q14651 629 aa25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 KCTD16Q68DU8 428 aa25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 SH2D3CQ8N5H7 860 aa25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 SAMD3Q8N6K7 520 aa25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 GOLPH3Q9H4A6 298 aa25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa25.04■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 H0YGN5 161 aa25.04■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 HSD17B4P51659 736 aa25.04■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 AGPAT1Q99943 283 aa25.04■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa25.04■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa25.04■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 RASAL2Q9UJF2 1139 aa25.04■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 NFS1Q9Y697 457 aa25.04■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 LYPLA2O95372 231 aa25.03■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 GGPS1O95749 300 aa25.03■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 P4HBP07237 508 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 CDR1P51861 262 aa25.03■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 MAPK7Q13164 816 aa25.03■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 COG2Q14746 738 aa25.03■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 EFCC1Q9HA90 598 aa25.03■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 CREBZFQ9NS37 354 aa25.03■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 RPTORQ8N122 1335 aa25.03■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 K7ENM7 598 aa25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 FGGP02679 453 aa25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 PTGISQ16647 500 aa25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 PADI6Q6TGC4 694 aa25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 MIER3Q7Z3K6 550 aa25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 UBL4BQ8N7F7 174 aa25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 ACER1Q8TDN7 264 aa25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 RUNDC3BQ96NL0 473 aa25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 AMACRQ9UHK6 382 aa25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 ARP10275 920 aa25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 ATP1A2P50993 1020 aa25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 DRG2P55039 364 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 GHRHRQ02643 423 aa25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 TMC3Q7Z5M5 1100 aa25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 CROCCP2Q86T23 111 aa25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 LMO3Q8TAP4 145 aa25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 BCAS3Q9H6U6 928 aa25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-207ENST00000530238 KIAA0754O94854 1291 aa25.01■■□□□ 1.59
BRMS1-207ENST00000530238 TRIM49P0CI25 452 aa25.01■■□□□ 1.59
BRMS1-207ENST00000530238 TRIM49CP0CI26 452 aa25.01■■□□□ 1.59
BRMS1-207ENST00000530238 VAMP7P51809 220 aa25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms