RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	SCD	O00767	359 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	TBX3	O15119	743 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ULK1	O75385	1050 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	TCEA3	O75764	348 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	KRT37	O76014	449 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	IL33	O95760	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC9A1	P19634	815 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	SDHA	P31040	664 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	GJA4	P35212	333 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	RAC3	P60763	192 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ERVK-21	P61565	698 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	DPT	Q07507	201 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	TUSC3	Q13454	348 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	GRM3	Q14832	879 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	TERF2	Q15554	542 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	GPR158	Q5T848	1215 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXO41	Q8TF61	875 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC5A5	Q92911	643 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ACOT7	O00154	380 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	APAF1	O14727	1248 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	HIP1R	O75146	1068 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	FGA	P02671	866 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	FAH	P16930	419 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	CYP2C19	P33261	490 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	KIF11	P52732	1056 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	SESN3	P58005	492 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	PFKP	Q01813	784 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	PTH1R	Q03431	593 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62	9e-8	■■■■□ 22.9
FAM49B-222	ENST00000522702	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	INAVA	Q3KP66	663 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	CPA6	Q8N4T0	437 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	AMER2	Q8N7J2	671 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ACSS2	Q9NR19	701 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ERC2	O15083	957 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	PLSCR1	O15162	318 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	MYL3	P08590	195 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	FNTB	P49356	437 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	GBX1	Q14549	363 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF174	Q15697	407 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	DDB1	Q16531	1140 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	BROX	Q5VW32	411 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	NME8	Q8N427	588 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM89A	Q96GI7	184 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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