RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 CYFIP1Q7L576 1253 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 HAUS6Q7Z4H7 955 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 PPM1KQ8N3J5 372 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 LRRN4CLQ8ND94 238 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM58Q8NG06 486 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 NEK9Q8TD19 979 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 TEPSINQ96N21 525 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 ACCSQ96QU6 501 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 FNBP1Q96RU3 617 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 EPAS1Q99814 870 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM4Q9C037 500 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 PXMP2Q9NR77 195 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 CEP72Q9P209 647 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 SEL1LQ9UBV2 794 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 EXOC7Q9UPT5 735 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 PHACTR2O75167 634 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 KRT38O76015 456 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 ABL1P00519 1130 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 FESP07332 822 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 GCLMP48507 274 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 VAV2P52735 878 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 SPIRE1Q08AE8 756 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 STRN3Q13033 797 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 GRM1Q13255 1194 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 PPP2R5CQ13362 524 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 KCTD2Q14681 263 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 SLC30A9Q6PML9 568 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 USP37Q86T82 979 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 IWS1Q96ST2 819 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 OSBPL9Q96SU4 736 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 LACRTQ9GZZ8 138 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 TRPV5Q9NQA5 729 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 PLAGL2Q9UPG8 496 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 DENND3A2RUS2 1198 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 FZD9O00144 591 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 TFRCP02786 760 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 PSAPP07602 524 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 MYL7Q01449 175 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 VGLL4Q14135 290 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 HYIQ5T013 277 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 KLRG1Q96E93 195 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 DNAJC7Q99615 494 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM206Q9H813 350 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 L2HGDHQ9H9P8 463 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 GINS2Q9Y248 185 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 SERPING1P05155 500 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 VDRP11473 427 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 TNNI1P19237 187 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 TNFAIP3P21580 790 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 SFNP31947 248 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 LIG4P49917 911 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 SOX10P56693 466 aa8.47□□□□□ -1.05
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TRPS1-208ENST00000519076 FRMD5Q7Z6J6 570 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM59Q8IWR1 403 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 DEPTORQ8TB45 409 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 HDAC7Q8WUI4 952 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC102AQ96A19 550 aa8.47□□□□□ -1.05
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TRPS1-208ENST00000519076 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 GINM1Q9NU53 330 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 SLC9A2Q9UBY0 812 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 ATP6V1G1O75348 118 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 KRT5P13647 590 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 UCHL3P15374 230 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 DSG3P32926 999 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 RARRES1P49788 294 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 CNTN2Q02246 1040 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 PDXDC1Q6P996 788 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 GJB7Q6PEY0 223 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM110Q86TL2 294 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 METTL13Q8N6R0 699 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 LMBR1Q8WVP7 490 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 BHMTQ93088 406 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 SLC10A4Q96EP9 437 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 RETREG1Q9H6L5 497 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 CD248Q9HCU0 757 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 VPS18Q9P253 973 aa8.46□□□□□ -1.05
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