RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515854.5

ATP2C1-223, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, human

TSL 4

Gene ATP2C1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C1-223	ENST00000515854	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	CEP72	Q9P209	647 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	TBX20	Q9UMR3	447 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	DENND3	A2RUS2	1198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCDC169	A6NNP5	214 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PMM2	O15305	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	EXOC3	O60645	756 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	LCA5L	O95447	670 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PIGR	P01833	764 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC9A1	P19634	815 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	GLRA2	P23416	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PON1	P27169	355 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ADORA2A	P29274	412 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ADSS	P30520	456 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	MAPK4	P31152	587 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	NAMPT	P43490	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC26A2	P50443	739 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CYP2J2	P51589	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SOX10	P56693	466 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	HUNK	P57058	714 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	KRT83	P78385	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ENPEP	Q07075	957 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	BFSP1	Q12934	665 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	LAMC2	Q13753	1193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	GRB14	Q14449	540 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TTLL4	Q14679	1199 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	EMC2	Q15006	297 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	GBP6	Q6ZN66	633 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ARMCX2	Q7L311	632 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	GPR142	Q7Z601	462 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	KIF18A	Q8NI77	898 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SCFD2	Q8WU76	684 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	FAM167A	Q96KS9	214 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	IFT74	Q96LB3	600 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	AZI2	Q9H6S1	392 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SIX2	Q9NPC8	291 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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