RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 ESR2Q92731 530 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 TCTN2Q96GX1 697 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 MYOZ2Q9NPC6 264 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
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HERC3-210ENST00000512194 U3KQE9 123 aa8.47□□□□□ -1.05
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HERC3-210ENST00000512194 WDR19Q8NEZ3 1342 aa8.47□□□□□ -1.05
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HERC3-210ENST00000512194 DOCK2Q92608 1830 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 MYH13Q9UKX3 1938 aa8.46□□□□□ -1.05
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HERC3-210ENST00000512194 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 H0Y8X5 98 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 PRODHO43272 600 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 DYRK3O43781 588 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 ENTPD3O75355 529 aa8.46□□□□□ -1.06
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HERC3-210ENST00000512194 SCG5P05408 212 aa8.46□□□□□ -1.06
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HERC3-210ENST00000512194 L1CAMP32004 1257 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 BMP8BP34820 402 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 GRIA2P42262 883 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 CTSKP43235 329 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
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HERC3-210ENST00000512194 C12orf60Q5U649 245 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
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HERC3-210ENST00000512194 IQCA1Q86XH1 822 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 TMTC2Q8N394 836 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 STAG1Q8WVM7 1258 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 HOOK2Q96ED9 719 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 UBAC1Q9BSL1 405 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 MTA3Q9BTC8 594 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 IER2Q9BTL4 223 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 IDI2Q9BXS1 227 aa8.46□□□□□ -1.06
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HERC3-210ENST00000512194 SWAP70Q9UH65 585 aa8.46□□□□□ -1.06
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HERC3-210ENST00000512194 PLAGL2Q9UPG8 496 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 FLT1P17948 1338 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 PRR19A6NJB7 356 aa8.45□□□□□ -1.06
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HERC3-210ENST00000512194 FOXP2O15409 715 aa8.45□□□□□ -1.06
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HERC3-210ENST00000512194 ADCK5Q3MIX3 580 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.45□□□□□ -1.06
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HERC3-210ENST00000512194 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
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HERC3-210ENST00000512194 PI4KBQ9UBF8 816 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 PLAAQ9Y263 795 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 LAMA3Q16787 3333 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 MYH7P12883 1935 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 TSPY2A6NKD2 308 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 B4E1Z4 1266 aa8.44□□□□□ -1.06
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HERC3-210ENST00000512194 PRC1O43663 620 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 ORC4O43929 436 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
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HERC3-210ENST00000512194 Q6ZUG5 572 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.44□□□□□ -1.06
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HERC3-210ENST00000512194 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
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HERC3-210ENST00000512194 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 SEMA3GQ9NS98 782 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 ZSWIM5Q9P217 1185 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 SERPINB13Q9UIV8 391 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 CLRN2A0PK11 232 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 CCDC69A6NI79 296 aa8.43□□□□□ -1.06
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