RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498454.1

TTYH3-207, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTYH3, Length 587 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3-207ENST00000498454 MAN1B1Q9UKM7 699 aa23.28■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa23.28■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 ERLIN2O94905 339 aa23.27■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 ABCD1P33897 745 aa23.27■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 STK4Q13043 487 aa23.27■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.321e-6■□□□□ 8.8
TTYH3-207ENST00000498454 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.329e-8■■□□□ 11.5
TTYH3-207ENST00000498454 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 KIAA0895Q8NCT3 520 aa23.27■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 DBF4BQ8NFT6 615 aa23.27■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 HVCN1Q96D96 273 aa23.27■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 VWCEQ96DN2 955 aa23.27■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa23.27■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 ACKR2O00590 384 aa23.26■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 TSPAN1O60635 241 aa23.26■■□□□ 1.31
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TTYH3-207ENST00000498454 STRN3Q13033 797 aa23.26■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa23.26■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 SEPT8Q92599 483 aa23.26■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 PRIMPOLQ96LW4 560 aa23.26■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 IL23AQ9NPF7 189 aa23.26■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 TBX20Q9UMR3 447 aa23.26■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 GDAQ9Y2T3 454 aa23.26■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 BIN1O00499 593 aa23.25■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 B4GALT5O43286 388 aa23.25■■□□□ 1.31
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TTYH3-207ENST00000498454 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 ISM2Q6H9L7 571 aa23.25■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 MAP4K3Q8IVH8 894 aa23.25■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa23.25■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 USP20Q9Y2K6 914 aa23.25■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 TTLL13PA6NNM8 815 aa23.24■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 TCTN1Q2MV58 587 aa23.24■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.24■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 ZNF507Q8TCN5 953 aa23.24■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 SCFD1Q8WVM8 642 aa23.24■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 APBB2Q92870 758 aa23.24■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 ACCSQ96QU6 501 aa23.24■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 TMX1Q9H3N1 280 aa23.24■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 UBE4BO95155 1302 aa23.24■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa23.24■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 ACRP10323 421 aa23.23■■□□□ 1.31
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TTYH3-207ENST00000498454 AXLP30530 894 aa23.23■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
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TTYH3-207ENST00000498454 TRIML1Q8N9V2 468 aa23.23■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 CPB2Q96IY4 423 aa23.23■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
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TTYH3-207ENST00000498454 EPHB4P54760 987 aa23.22■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 DSC3Q14574 896 aa23.22■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 BMT2Q1RMZ1 405 aa23.22■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 TMEM132AQ24JP5 1023 aa23.22■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 MYOCDQ8IZQ8 938 aa23.22■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 FTHL17Q9BXU8 183 aa23.22■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 CHST12Q9NRB3 414 aa23.22■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 EXOC7Q9UPT5 735 aa23.22■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 H0YGN5 161 aa23.21■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 MGEA5O60502 916 aa23.21■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 BMP6P22004 513 aa23.21■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 HOXD13P35453 343 aa23.21■■□□□ 1.31
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TTYH3-207ENST00000498454 ZPBP2Q6X784 338 aa23.21■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 C16orf59Q7L2K0 433 aa23.21■■□□□ 1.31
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TTYH3-207ENST00000498454 BICD1Q96G01 975 aa23.21■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 TMEM206Q9H813 350 aa23.21■■□□□ 1.31
TTYH3-207ENST00000498454 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa23.2■■□□□ 1.3
TTYH3-207ENST00000498454 N4BP3O15049 544 aa23.2■■□□□ 1.3
TTYH3-207ENST00000498454 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
TTYH3-207ENST00000498454 LIG4P49917 911 aa23.2■■□□□ 1.3
TTYH3-207ENST00000498454 ATF7IP2Q5U623 682 aa23.2■■□□□ 1.3
TTYH3-207ENST00000498454 EEF1DP3Q658K8 133 aa23.2■■□□□ 1.3
TTYH3-207ENST00000498454 NOTUMQ6P988 496 aa23.2■■□□□ 1.3
TTYH3-207ENST00000498454 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
TTYH3-207ENST00000498454 SYCP3Q8IZU3 236 aa23.2■■□□□ 1.3
TTYH3-207ENST00000498454 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
TTYH3-207ENST00000498454 LINC01599Q8WXQ3 324 aa23.2■■□□□ 1.3
TTYH3-207ENST00000498454 CCDC51Q96ER9 411 aa23.2■■□□□ 1.3
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