RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 INSL6Q9Y581 213 aa9.56□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 A0A0U1RQF3 1178 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 LINC01553A4QN01 128 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 MYMKA6NI61 221 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 CCDC169A6NNP5 214 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 DGKIO75912 1065 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 FGFR1P11362 822 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 PLS3P13797 630 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 LIG1P18858 919 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 TAP1Q03518 808 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 TPRNQ4KMQ1 711 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 UBXN11Q5T124 520 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 RESP18Q5W5W9 173 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 GPR153Q6NV75 609 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 DYMQ7RTS9 669 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 TAS1R3Q7RTX0 852 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 STAMQ92783 540 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 YME1L1Q96TA2 773 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 ZNF576Q9H609 170 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 CERS4Q9HA82 394 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 KMT5AQ9NQR1 393 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 FAM105AQ9NUU6 356 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 RNF19AQ9NV58 838 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 TMEM161AQ9NX61 479 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 DACT1Q9NYF0 836 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 FAM13BQ9NYF5 915 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 LRFN2Q9ULH4 789 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 ODF2LQ9ULJ1 636 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa9.55□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 TMEM265A0A087WTH1 108 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 A0A1B0GVL5 298 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 EPOPA6NHQ4 379 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 MEIS3P2A8K0S8 358 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 SLC16A4O15374 487 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 FAM13AO94988 1023 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 PRKCBP05771 671 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 KRT18P05783 430 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 LINC00271P0C7V0 271 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 STAG3L1P0CL83 205 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 AXLP30530 894 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 ZNF131P52739 623 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 GRIN2CQ14957 1233 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 MAPK6Q16659 721 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 FAM187BQ17R55 369 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 LONRF3Q496Y0 759 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 IER5LQ5T953 404 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 ADALQ6DHV7 355 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 SV2BQ7L1I2 683 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 DEFB123Q8N688 67 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 RNF169Q8NCN4 708 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 DDX12PQ92771 950 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 LPPQ93052 612 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 C2orf40Q9H1Z8 148 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 ZHX3Q9H4I2 956 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 C17orf75Q9HAS0 396 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 HCSTQ9UBK5 93 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 TTC3P53804 2025 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa9.54□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 A0A1B0GUA9 196 aa9.53□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 TBKBP1A7MCY6 615 aa9.53□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 K7ERI5 159 aa9.53□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 ACKR2O00590 384 aa9.53□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 TBCAO75347 108 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 PFKFB1P16118 471 aa9.53□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 CMA1P23946 247 aa9.53□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 NCKAP1LP55160 1127 aa9.53□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 CLLU1OSQ5K130 101 aa9.53□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 NT5DC1Q5TFE4 455 aa9.53□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 EEF1DP3Q658K8 133 aa9.53□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 NOTUMQ6P988 496 aa9.53□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 MYCT1Q8N699 235 aa9.53□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 IQUBQ8NA54 791 aa9.53□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa9.53□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 SPIRE2Q8WWL2 714 aa9.53□□□□□ -0.88
PKP4-216ENST00000495123 DNAJC19Q96DA6 116 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms