RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 SGPP1Q9BX95 441 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM60Q9H2L4 133 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP9.73□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 SLC16A6O15403 523 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 TUSC2O75896 110 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 ENDOD1O94919 500 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 LY86O95711 162 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 RHCEP18577 417 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 LIMS1P48059 325 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 RHDQ02161 417 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 CD69Q07108 199 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 PPP3CAQ08209 521 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 C3orf36Q3SXR2 165 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 GORABQ5T7V8 394 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 TTC7BQ86TV6 843 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 DPF2Q92785 391 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 GCM1Q9NP62 436 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 DMRT3Q9NQL9 472 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 TPP1O14773 563 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 AKR1B10O60218 316 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 UBXN7O94888 489 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 COL6A1P12109 1028 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 CTSSP25774 331 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 IL13P35225 146 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 DLG4P78352 724 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 OVCH2Q7RTZ1 564 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 FAM129CQ86XR2 697 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 SIGLEC10Q96LC7 697 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 UIMC1Q96RL1 719 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 CHST12Q9NRB3 414 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 SGTAO43765 313 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 B3GALT2O43825 422 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 HMGCRP04035 888 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 ETV4P43268 484 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 KCNQ1P51787 676 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 FAM193AP78312 1265 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 GALEQ14376 348 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 C19orf54Q5BKX5 351 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 PRR31Q5SQ13 230 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC149Q6ZUS6 474 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 SNX33Q8WV41 574 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 L2HGDHQ9H9P8 463 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 IRAK3Q9Y616 596 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM127O75204 238 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 MYBP10242 640 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 GAAP10253 952 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 RPL13P26373 211 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 MEOX1P50221 254 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 CACNB3P54284 484 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 TAS1R1Q7RTX1 841 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 DRC7Q8IY82 874 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 RTKN2Q8IZC4 609 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R35Q8TAP8 253 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 SLC39A13Q96H72 371 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 MANSC1Q9H8J5 431 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 FAM50BQ9Y247 325 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 PRAMEF4O60810 478 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 ALDH2P05091 517 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF28P17035 718 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 ECHS1P30084 290 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 STAT5BP51692 787 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 IL10RAQ13651 578 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 VPS72Q15906 364 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 ANO6Q4KMQ2 910 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM68Q6AZZ1 485 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 IL31Q6EBC2 164 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 REXO1L1PQ8IX06 675 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 FNIP1Q8TF40 1166 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 LPPQ93052 612 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 CGRRF1Q99675 332 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 KCNK12Q9HB15 430 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 POLHQ9Y253 713 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 APAF1O14727 1248 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL18O94889 574 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP9.67□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 HTR1BP28222 390 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 LLGL1Q15334 1064 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC157Q569K6 752 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 DAAM2Q86T65 1068 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 RHOT1Q8IXI2 618 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRC-212ENST00000491302 RGMAQ96B86 450 aa9.67□□□□□ -0.86
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