RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484358.1

RPL3-216, Transcript of ribosomal protein L3, humanhuman

TSL 2

Gene RPL3, Length 557 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3-216ENST00000484358 PIGRP01833 764 aa14.78□□□□□ -0.04
RPL3-216ENST00000484358 GARTP22102 1010 aa14.78□□□□□ -0.04
RPL3-216ENST00000484358 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
RPL3-216ENST00000484358 PMS1P54277 932 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
RPL3-216ENST00000484358 UBASH3AP57075 661 aa14.78□□□□□ -0.04
RPL3-216ENST00000484358 PTENP60484 403 aa14.78□□□□□ -0.04
RPL3-216ENST00000484358 ADAM17P78536 824 aa14.78□□□□□ -0.04
RPL3-216ENST00000484358 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.78□□□□□ -0.04
RPL3-216ENST00000484358 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
RPL3-216ENST00000484358 CCDC40Q4G0X9 1142 aa14.78□□□□□ -0.04
RPL3-216ENST00000484358 FAM47CQ5HY64 1035 aa14.78□□□□□ -0.04
RPL3-216ENST00000484358 ARMCX5Q6P1M9 558 aa14.78□□□□□ -0.04
RPL3-216ENST00000484358 ZPBP2Q6X784 338 aa14.78□□□□□ -0.04
RPL3-216ENST00000484358 NLRP7Q8WX94 980 aa14.78□□□□□ -0.04
RPL3-216ENST00000484358 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.78□□□□□ -0.04
RPL3-216ENST00000484358 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
RPL3-216ENST00000484358 MED15Q96RN5 788 aa14.78□□□□□ -0.04
RPL3-216ENST00000484358 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
RPL3-216ENST00000484358 RNF208Q9H0X6 261 aa14.78□□□□□ -0.04
RPL3-216ENST00000484358 KIAA1586Q9HCI6 787 aa14.78□□□□□ -0.04
RPL3-216ENST00000484358 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.78□□□□□ -0.04
RPL3-216ENST00000484358 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
RPL3-216ENST00000484358 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa14.77□□□□□ -0.04
RPL3-216ENST00000484358 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.77□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 MAPK13O15264 365 aa14.77□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 TGFB1I1O43294 461 aa14.77□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 ADCY5O95622 1261 aa14.77□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 LDHAP00338 332 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 PRKCBP05771 671 aa14.77□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 CCL5P13501 91 aa14.77□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 CDC25BP30305 580 aa14.77□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 HOXD13P35453 343 aa14.77□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 MARSP56192 900 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 DRP2Q13474 957 aa14.77□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 ITGA7Q13683 1181 aa14.77□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 FAM187BQ17R55 369 aa14.77□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 LRRC55Q6ZSA7 311 aa14.77□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.77□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 CREBRFQ8IUR6 639 aa14.77□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa14.77□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 KIFC3Q9BVG8 833 aa14.77□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.77□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 HSD3B7Q9H2F3 369 aa14.77□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 PHF24Q9UPV7 400 aa14.77□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 NOD1Q9Y239 953 aa14.77□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.76□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.76□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 ACKR2O00590 384 aa14.76□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 EXOC3O60645 756 aa14.76□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 CAND2O75155 1236 aa14.76□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 GPC3P51654 580 aa14.76□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 ZNF75DP51815 510 aa14.76□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 MAN2A1Q16706 1144 aa14.76□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 TMEM132AQ24JP5 1023 aa14.76□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 RPAINQ86UA6 219 aa14.76□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 XXYLT1Q8NBI6 393 aa14.76□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 POMGNT1Q8WZA1 660 aa14.76□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.76□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 DMAC2Q9NW81 257 aa14.76□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 IFNKQ9P0W0 207 aa14.76□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 N4BP3O15049 544 aa14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 TREHO43280 583 aa14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 ERLIN2O94905 339 aa14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 VTNP04004 478 aa14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 ATP1A3P13637 1013 aa14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 KRT13P13646 458 aa14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 CYP2J2P51589 502 aa14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 ENPEPQ07075 957 aa14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 KCNA1Q09470 495 aa14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 KRT31Q15323 416 aa14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 KYAT1Q16773 422 aa14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 FKBP15Q5T1M5 1219 aa14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 CEP135Q66GS9 1140 aa14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 DRC7Q8IY82 874 aa14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 FAM186BQ8IYM0 893 aa14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 DEFB118Q96PH6 123 aa14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 FZD8Q9H461 694 aa14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 OGDHLQ9ULD0 1010 aa14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 A0A087WZ62 844 aa14.74□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 A0A1B0GTH6 734 aa14.74□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 A0A1W2PQY0 241 aa14.74□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 PES1O00541 588 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 CLIC2O15247 247 aa14.74□□□□□ -0.05
RPL3-216ENST00000484358 STX10O60499 249 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms