RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 MED24O75448 989 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 PYGLP06737 847 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 TARSP26639 723 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 KLRC3Q07444 240 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 TRAF1Q13077 416 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 AADACL2Q6P093 401 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA21Q7Z572 469 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 SCFD2Q8WU76 684 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 RPS6KC1Q96S38 1066 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 RASAL2Q9UJF2 1139 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 C2CD2Q9Y426 696 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ESYT2A0FGR8 921 aa17.43■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 PPP1R2P41236 205 aa17.43■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 RPS6KA3P51812 740 aa17.43■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 NBPF20Q3BBV1 942 aa17.43■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC174Q6PII3 467 aa17.43■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 CFBP00751 764 aa17.43■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 C6orf118Q5T5N4 469 aa17.43■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 RNF220Q5VTB9 566 aa17.43■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 GJB7Q6PEY0 223 aa17.43■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF131P52739 623 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 USP4Q13107 963 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 PLS1Q14651 629 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 RFX8Q6ZV50 586 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 PIGOQ8TEQ8 1089 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 HAO1Q9UJM8 370 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 SBF2Q86WG5 1849 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 NPR1P16066 1061 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 KCNJ1P48048 391 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 CASP5P51878 434 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 RGL1Q9NZL6 768 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 RSPH10B2B2RC85 870 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 CLIC2O15247 247 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ECE2O60344 883 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 LCA5LO95447 670 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 RSPH10BP0C881 870 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 JAG1P78504 1218 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 KCNH2Q12809 1159 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 RASIP1Q5U651 963 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 BCS1LQ9Y276 419 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 SNHG28P0DPA3 235 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 RAB27AP51159 221 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ABCB5Q2M3G0 1257 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 FITM2Q8N6M3 262 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 TPCN2Q8NHX9 752 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ERP27Q96DN0 273 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 USH1CQ9Y6N9 552 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1B0GVG6 124 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ALDH1B1P30837 517 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ECE1P42892 770 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGAP4P98171 946 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 RIPK1Q13546 671 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 CAPN12Q6ZSI9 719 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC65Q8IXS2 484 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 DTX3LQ8TDB6 740 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 DNAJC19Q96DA6 116 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 C18orf8Q96DM3 657 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 EMILIN3Q9NT22 766 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 FAM198AQ9UFP1 575 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 NAGPAQ9UK23 515 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB39O15060 712 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 PAEPP09466 180 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC63Q05C16 580 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 PIGWQ7Z7B1 504 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 NLGN1Q8N2Q7 840 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ERP44Q9BS26 406 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 TAOK3Q9H2K8 898 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 CETN3O15182 167 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 FERP16591 822 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 TUBP50607 506 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 CALCOCO2Q13137 446 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 PDIA5Q14554 519 aa17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms