RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481173.1

CCNL1-223, Transcript of cyclin L1, human

TSL 2

Gene CCNL1, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNL1-223	ENST00000481173	USP14	P54578	494 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	BCAR1	P56945	870 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	UIMC1	Q96RL1	719 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	PIF1	Q9H611	641 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	CABP5	Q9NP86	173 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	ACSS2	Q9NR19	701 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	MTSS1	O43312	755 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	APOL3	O95236	402 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	SLC9A1	P19634	815 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	CFAP100	Q494V2	611 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	MTG2	Q9H4K7	406 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	RSAD1	Q9HA92	442 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173		H7C1D1	291 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	NCR1	O76036	304 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	GAA	P10253	952 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	CASR	P41180	1078 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	PTH2R	P49190	550 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	ADCY2	Q08462	1091 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF174	Q15697	407 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	VPS72	Q15906	364 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	LCORL	Q8N3X6	602 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	SOX7	Q9BT81	388 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173		A0A0A6YYJ9	748 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	CBX4	O00257	560 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	DNAJC6	O75061	913 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	ALDH1A2	O94788	518 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	NDUFA10	O95299	355 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	CYP17A1	P05093	508 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	FLT3	P36888	993 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	TAP1	Q03518	808 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	EPHA7	Q15375	998 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	NDC1	Q9BTX1	674 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	MYL10	Q9BUA6	226 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	TMEM260	Q9NX78	707 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	LEFTY2	O00292	366 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	OPHN1	O60890	802 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	PLA2G5	P39877	138 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	FAM83A	Q86UY5	434 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	NME9	Q86XW9	330 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	XYLT1	Q86Y38	959 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	UBXN4	Q92575	508 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	TEX101	Q9BY14	249 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	POFUT1	Q9H488	388 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	NRP1	O14786	923 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	KPNA6	O60684	536 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	RFPL3	O75679	317 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	FSBP	O95073	299 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	TYRP1	P17643	537 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	NEK4	P51957	841 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	TKFC	Q3LXA3	575 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	C7orf31	Q8N865	590 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNL1-223	ENST00000481173	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms