RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 USP17L5A8MUK1 530 aa18.26■□□□□ 0.51
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBN2Q6ZU65 1347 aa18.26■□□□□ 0.51
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARMCX2Q7L311 632 aa18.25■□□□□ 0.51
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa18.25■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TCP11X1B4DZS4 312 aa18.25■□□□□ 0.51
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM260Q9NX78 707 aa18.24■□□□□ 0.51
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SNX12Q9UMY4 172 aa18.24■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POTEB3A0JP26 581 aa18.23■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POTECB2RU33 542 aa18.23■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.516e-7■■■□□ 15
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.513e-6■■■■□ 20.1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POTEBQ6S5H4 581 aa18.23■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RASSF3Q86WH2 238 aa18.23■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IL17RAQ96F46 866 aa18.23■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MS4A14Q96JA4 679 aa18.23■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GGPS1O95749 300 aa18.23■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EEPD1Q7L9B9 569 aa18.23■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNF217Q8TC41 542 aa18.23■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC90BQ9GZT6 254 aa18.23■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VAMP7P51809 220 aa18.23■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCNYL1Q8N7R7 359 aa18.23■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
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