RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 NCAM2O15394 837 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 TIMM44O43615 452 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 IL18RAPO95256 599 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR15P49685 360 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 HK3P52790 923 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 MGAT2Q10469 447 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 NOGQ13253 232 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 DAG1Q14118 895 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 KCTD2Q14681 263 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 NUP43Q8NFH3 380 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 IL31RAQ8NI17 732 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 NETO1Q8TDF5 533 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 PPM1MQ96MI6 270 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 NEUROD6Q96NK8 337 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP1R16BQ96T49 567 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 JADE2Q9NQC1 790 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 LMBRD1Q9NUN5 540 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 UCKL1Q9NWZ5 548 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 PALD1Q9ULE6 856 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1B0GVC2 190 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC14BA6NHZ5 514 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 APOL1O14791 398 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 SGSM2O43147 1006 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 OPHN1O60890 802 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 FAHP16930 419 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 SMARCA1P28370 1054 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC7A1P30825 629 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 HSPA7P48741 367 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.263e-45■■■■■ 92.7
RABGGTB-209ENST00000473406 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF43Q68DV7 783 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 GALNT18Q6P9A2 607 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP26C1Q6V0L0 522 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 TMC6Q7Z403 805 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF152Q8N8N0 203 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 NETO2Q8NC67 525 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 ARRDC4Q8NCT1 418 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2I1PQ8NGU4 316 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 CALML6Q8TD86 181 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC35A4Q96G79 324 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 C7orf25Q9BPX7 421 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 COLEC11Q9BWP8 271 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 EBF1Q9UH73 591 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 GJD2Q9UKL4 321 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 DYTNA2CJ06 578 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 ISM1B1AKI9 464 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 H3BUI4 141 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 EXOC5O00471 708 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 NFIBO00712 420 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 FFAR2O15552 330 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 GLI4P10075 376 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 BRAFP15056 766 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 COL8A1P27658 744 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 SETQ01105 290 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP3CAQ08209 521 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 CNGA2Q16280 664 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 MPEG1Q2M385 716 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC178Q5BJE1 867 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 GAREM2Q75VX8 874 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 C3orf20Q8ND61 904 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 ASB11Q8WXH4 323 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM167AQ96KS9 214 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 PDP2Q9P2J9 529 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 ACSL6Q9UKU0 697 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 WASF3Q9UPY6 502 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 CEP83Q9Y592 693 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 USP19O94966 1318 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 MYO1FO00160 1098 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 SGTAO43765 313 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 NRP2O60462 931 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 MPIG6BO95866 241 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 PYGLP06737 847 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 THP07101 528 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 DHRS4L1P0CG22 281 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 KITP10721 976 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms