RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 FOSP01100 380 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 APEX1P27695 318 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 FAM83AQ86UY5 434 aa2.48□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF227Q86WZ6 799 aa2.48□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa2.48□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 SEMA4CQ9C0C4 833 aa2.48□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 CPNE5Q9HCH3 593 aa2.48□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa2.48□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 LINC01548A6NM66 108 aa2.47□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 DNAJC6O75061 913 aa2.47□□□□□ -2.01
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SHQ1-204ENST00000468347 NHLH2Q02577 135 aa2.47□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 KIZQ2M2Z5 673 aa2.47□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa2.47□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa2.47□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 ARMC6Q6NXE6 501 aa2.47□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 SPEM1Q8N4L4 309 aa2.47□□□□□ -2.01
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SHQ1-204ENST00000468347 PHF20Q9BVI0 1012 aa2.47□□□□□ -2.01
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SHQ1-204ENST00000468347 HS2ST1Q7LGA3 356 aa2.46□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 CRBNQ96SW2 442 aa2.46□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM260Q9NX78 707 aa2.46□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 A0A1B0GVY2 172 aa2.45□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 EPHB2P29323 1055 aa2.45□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 MXRA7P84157 204 aa2.45□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 LCE1CQ5T751 118 aa2.45□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 LCE1FQ5T754 118 aa2.45□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.45□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 CCDC81Q6ZN84 652 aa2.45□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 SYT12Q8IV01 421 aa2.45□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 MRS2Q9HD23 443 aa2.45□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa2.45□□□□□ -2.02
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SHQ1-204ENST00000468347 CD1AP06126 327 aa2.44□□□□□ -2.02
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SHQ1-204ENST00000468347 ANTXR2P58335 489 aa2.44□□□□□ -2.02
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SHQ1-204ENST00000468347 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 DOK3Q7L591 496 aa2.44□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 LYZL4Q96KX0 146 aa2.44□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa2.43□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 LATS1O95835 1130 aa2.43□□□□□ -2.02
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SHQ1-204ENST00000468347 CALML6Q8TD86 181 aa2.43□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 ENKD1Q9H0I2 346 aa2.43□□□□□ -2.02
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SHQ1-204ENST00000468347 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
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SHQ1-204ENST00000468347 MTSS1O43312 755 aa2.42□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 SUSD5O60279 629 aa2.42□□□□□ -2.02
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SHQ1-204ENST00000468347 ALPLP05186 524 aa2.42□□□□□ -2.02
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SHQ1-204ENST00000468347 HDAC5Q9UQL6 1122 aa2.42□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 WNT6Q9Y6F9 365 aa2.42□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 CFIP05156 583 aa2.41□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 MMP13P45452 471 aa2.41□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 GIPRP48546 466 aa2.41□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 GPR19Q15760 415 aa2.41□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 BTNL9Q6UXG8 535 aa2.41□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 ASB15Q8WXK1 588 aa2.41□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 KCTD13Q8WZ19 329 aa2.41□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 VPS16Q9H269 839 aa2.41□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 MMP24Q9Y5R2 645 aa2.41□□□□□ -2.02
SHQ1-204ENST00000468347 FAM90A10PA6NDY2 464 aa2.4□□□□□ -2.03
SHQ1-204ENST00000468347 CAPNS1P04632 268 aa2.4□□□□□ -2.03
SHQ1-204ENST00000468347 AMY2AP04746 511 aa2.4□□□□□ -2.03
SHQ1-204ENST00000468347 AMY2BP19961 511 aa2.4□□□□□ -2.03
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